88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3638 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  99.5 
 
 
200 aa  406  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  98.04 
 
 
292 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  77.4 
 
 
210 aa  321  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  80.88 
 
 
203 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  83 
 
 
202 aa  290  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  84.09 
 
 
202 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  80.88 
 
 
203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  80.88 
 
 
203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  80.88 
 
 
203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  80.39 
 
 
203 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  59.16 
 
 
193 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  38.6 
 
 
189 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218689  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  37.98 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  32.21 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  38.18 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  36.94 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  36.94 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  36.36 
 
 
240 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  30.38 
 
 
167 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  33.04 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  33.33 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  27.84 
 
 
251 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  36.36 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  30.16 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  29.01 
 
 
154 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
166 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  34.34 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  34.34 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  34.34 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  34.34 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  34.34 
 
 
172 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  34.34 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  34.34 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  34 
 
 
168 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  34 
 
 
168 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  28.24 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  28.88 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  28.12 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  30.63 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  34.34 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  32.99 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  26.29 
 
 
151 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  33.33 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 
166 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  31.36 
 
 
162 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  28.68 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  31.21 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  31.21 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  31.21 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  33 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  31.21 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  29.13 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  28.8 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  27.68 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  28.17 
 
 
163 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  28.17 
 
 
163 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  28.17 
 
 
163 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  28.17 
 
 
163 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  29.14 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.16 
 
 
172 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  28.21 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.29 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  31.33 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  33.05 
 
 
156 aa  48.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  26.8 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  24.6 
 
 
156 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  28.23 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  27.4 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  24.53 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  27.4 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  25.47 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  27.56 
 
 
157 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  24.53 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  30.85 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  23.29 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  26.53 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  28.87 
 
 
155 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  26.42 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  28.3 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  36.36 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  36.36 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  36.36 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.48 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  26.67 
 
 
193 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>