28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3626 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  98.78 
 
 
329 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  88.79 
 
 
330 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0458  hypothetical protein  87.84 
 
 
329 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2621  hypothetical protein  87.84 
 
 
329 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0484  hypothetical protein  87.84 
 
 
329 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2908  hypothetical protein  87.5 
 
 
329 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0419  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.659146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0392  hypothetical protein  86.63 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3574  hypothetical protein  86.93 
 
 
329 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  61.28 
 
 
328 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04697  hypothetical protein  42.86 
 
 
327 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00670178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  41.21 
 
 
327 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  28.51 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  31.31 
 
 
483 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  23.21 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  23.63 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  27.5 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  29.63 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  28.09 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  24.56 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  30.34 
 
 
176 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>