23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3045 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3045  Signal recognition particle GTPase  100 
 
 
514 aa  1073    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.698368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4289  signal recognition particle GTPase  36.81 
 
 
405 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  36.84 
 
 
1065 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  31.55 
 
 
1170 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  32.5 
 
 
967 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  31.36 
 
 
1009 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  30.59 
 
 
1039 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  30.06 
 
 
1010 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  30.77 
 
 
1009 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  28.1 
 
 
971 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4290  hypothetical protein  42.71 
 
 
669 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5348  Primase 2  25.87 
 
 
1169 aa  63.9  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.396058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  29.41 
 
 
1015 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5262  hypothetical protein  23.62 
 
 
1336 aa  63.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3915  hypothetical protein  30.99 
 
 
1283 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2433  hypothetical protein  30.81 
 
 
1387 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  29.76 
 
 
1003 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  30 
 
 
962 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  29.55 
 
 
1034 aa  56.6  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  29.81 
 
 
1227 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2633  hypothetical protein  31.25 
 
 
999 aa  53.5  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.753628  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4533  hypothetical protein  28.57 
 
 
1403 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0371536  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0207  signal recognition particle protein FtsY  27.51 
 
 
284 aa  44.3  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>