More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2917 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0980  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  904    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2917  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  956    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0462  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
458 aa  904    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3022  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
458 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2608  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  904    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  97.82 
 
 
458 aa  861    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2977  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0167  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  904    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2527  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.69 
 
 
444 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3105  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.49 
 
 
458 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5276  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.01 
 
 
466 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420426  normal  0.809704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0224  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.41 
 
 
436 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274555  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5288  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.81 
 
 
430 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.27 
 
 
442 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.63 
 
 
443 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  39.82 
 
 
445 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  39.82 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  39.82 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  39.82 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.6 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.69 
 
 
441 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 
440 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.94 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.26 
 
 
449 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.51 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  38.72 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  38.72 
 
 
442 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.72 
 
 
442 aa  313  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  39.6 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.6 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.6 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.6 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  39.6 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  39.6 
 
 
445 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  39.6 
 
 
445 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 
449 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  40.23 
 
 
429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.61 
 
 
449 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.92 
 
 
445 aa  309  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.51 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  38.05 
 
 
449 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  40.68 
 
 
428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  38.05 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.05 
 
 
446 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  42.01 
 
 
430 aa  306  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  42.01 
 
 
430 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  40.68 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.11 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  40.27 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.33 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.88 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4208  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  39.16 
 
 
445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.12 
 
 
443 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.88 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.55 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  40 
 
 
429 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 
432 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.8 
 
 
441 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  39.5 
 
 
433 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  39.5 
 
 
433 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  39.5 
 
 
433 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  39.73 
 
 
433 aa  302  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  39.95 
 
 
433 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.24 
 
 
430 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.85 
 
 
449 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.68 
 
 
445 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.32 
 
 
430 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.47 
 
 
460 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  40.5 
 
 
433 aa  299  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.54 
 
 
431 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.28 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  39.41 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  39.01 
 
 
465 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  37.33 
 
 
436 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.96 
 
 
453 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 
431 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.07 
 
 
446 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.41 
 
 
433 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.91 
 
 
436 aa  296  5e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  38.79 
 
 
465 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.04 
 
 
433 aa  295  8e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.56 
 
 
431 aa  295  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
433 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.79 
 
 
446 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
433 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.32 
 
 
431 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 
431 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.32 
 
 
470 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
433 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.32 
 
 
448 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
433 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
433 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.15 
 
 
433 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.73 
 
 
434 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.73 
 
 
434 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.32 
 
 
470 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 
445 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 
445 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>