251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2347 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  98.93 
 
 		 307 aa  527  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  99.29 
 
 		 278 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  98.93 
 
 		 307 aa  527  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  99.29 
 
 		 278 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  99.29 
 
 		 278 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  92.86 
 
 		 278 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  76.79 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  76.43 
 
 		 303 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  77.14 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  77.14 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  77.14 
 
 		 277 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  77.14 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  77.58 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  69.18 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  69.2 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  69.57 
 
 		 292 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  46.91 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  46.55 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  43.59 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  46.38 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  44.2 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  43.48 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  43.48 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  42.18 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  41.45 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  43.21 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  46.26 
 
 		 287 aa  224  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  42.75 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  46.01 
 
 		 286 aa  221  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  41.16 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  41.39 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  42.49 
 
 		 302 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  43.64 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  45.09 
 
 		 276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  39.57 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  41.67 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  38.55 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  38.43 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  38.79 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  37.5 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  39.86 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  29.18 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  28.31 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  30.82 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  30.53 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  28.47 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  28.47 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  29.81 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  26.81 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  30 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  29.06 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  28.42 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  27.44 
 
 		 310 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  25.27 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  32.58 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  26.02 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  29.12 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  31.92 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  25.81 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  26.91 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  29.07 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  22.88 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  28.62 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3405  squalene synthase HpnC  28.99 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151553  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  26.2 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25.84 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  24 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  29.78 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.97 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0469  Squalene/phytoene synthase  29.3 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  22.96 
 
 		 302 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1548  squalene/phytoene synthase  28.98 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  23.55 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  25.81 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  24.8 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  30.97 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  23.7 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  28.98 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  23.33 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  23.19 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  23.9 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  23.9 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3811  Squalene/phytoene synthase  29.64 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  25.19 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  23.86 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  22.76 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2245  squalene synthase HpnC  25.09 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  27.9 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0577  squalene/phytoene synthase  31.99 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  25.09 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  27.07 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  27.5 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  27.61 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  26.57 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  27.1 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  26.76 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2157  squalene synthase HpnC  32.46 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.324406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  27.51 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>