66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2080 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  92.35 
 
 
366 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  753    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  99.73 
 
 
366 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  84.53 
 
 
365 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  92.35 
 
 
366 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  92.08 
 
 
366 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  92.08 
 
 
366 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  92.35 
 
 
366 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  98.36 
 
 
366 aa  740    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  92.08 
 
 
366 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
366 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  92.35 
 
 
366 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  99.73 
 
 
366 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  83.7 
 
 
365 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  83.89 
 
 
365 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  55.77 
 
 
373 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  55.37 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  54.8 
 
 
367 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  51.8 
 
 
373 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  56.21 
 
 
379 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  52.41 
 
 
367 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  54.08 
 
 
385 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  51.82 
 
 
392 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  52.75 
 
 
393 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  51.41 
 
 
380 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  52.41 
 
 
389 aa  352  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51.57 
 
 
367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  52.69 
 
 
389 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  50.53 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  49.86 
 
 
376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  45.15 
 
 
379 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  46.07 
 
 
376 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  47.06 
 
 
385 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  46.24 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  46.24 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.29 
 
 
360 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  41.57 
 
 
360 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  42.82 
 
 
354 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  39.83 
 
 
354 aa  288  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  33.85 
 
 
392 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  32.05 
 
 
385 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  32.57 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.34 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  29.46 
 
 
348 aa  116  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.79 
 
 
347 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  30.4 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  32.26 
 
 
346 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.26 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 
387 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 
403 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.2 
 
 
748 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  29.88 
 
 
454 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  21.69 
 
 
444 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  29.19 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 
222 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  25.76 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  23.33 
 
 
439 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2697  hypothetical protein  32.56 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208385  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  20.69 
 
 
450 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  33.59 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  32.67 
 
 
408 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  23.6 
 
 
934 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>