More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1770 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  80.19 
 
 
450 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  79.03 
 
 
440 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  79.58 
 
 
451 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  100 
 
 
447 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  92.06 
 
 
447 aa  814    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  75.29 
 
 
438 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  98.14 
 
 
446 aa  852    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  92.77 
 
 
447 aa  817    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  79.58 
 
 
451 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  89.25 
 
 
469 aa  782    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  100 
 
 
447 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  93.01 
 
 
455 aa  819    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  87.79 
 
 
469 aa  779    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  79.91 
 
 
438 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  91.59 
 
 
450 aa  812    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  93.71 
 
 
454 aa  821    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  91.59 
 
 
450 aa  812    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  73.65 
 
 
440 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1776  tight adherence protein TadA  99.7 
 
 
335 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0119  secretion system protein, putaive  99.7 
 
 
335 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0220928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  91.59 
 
 
450 aa  812    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  100 
 
 
447 aa  902    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  64.87 
 
 
449 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  58.66 
 
 
444 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  58.66 
 
 
444 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  49.26 
 
 
417 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  46.87 
 
 
451 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  48.79 
 
 
450 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  47.72 
 
 
459 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  48.31 
 
 
452 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  47.13 
 
 
624 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  45.01 
 
 
462 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  47.58 
 
 
449 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  44.44 
 
 
472 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  49.47 
 
 
438 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  45.43 
 
 
479 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  46.6 
 
 
467 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  47.5 
 
 
456 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.04 
 
 
445 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  49.63 
 
 
560 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  44.82 
 
 
460 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
444 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  47.83 
 
 
481 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  49.73 
 
 
468 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  49.05 
 
 
463 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  50.75 
 
 
608 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  43.61 
 
 
464 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  45.87 
 
 
441 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  43.72 
 
 
454 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  44.37 
 
 
442 aa  362  8e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  51.33 
 
 
418 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  44.71 
 
 
455 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.47 
 
 
473 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
437 aa  359  7e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  50.8 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  50.53 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  46.21 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55890  putative type II secretion system protein  47.02 
 
 
421 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
455 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  46.11 
 
 
453 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  47.99 
 
 
455 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  45.82 
 
 
455 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  44.08 
 
 
455 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  45.02 
 
 
454 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  45.02 
 
 
454 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4869  putative type II secretion system protein  49.1 
 
 
421 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  44.08 
 
 
455 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  44.82 
 
 
455 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
491 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  45.02 
 
 
454 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.06 
 
 
455 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  44.79 
 
 
491 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  44.86 
 
 
463 aa  352  7e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  47.04 
 
 
463 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  43.13 
 
 
454 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  47.04 
 
 
465 aa  351  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  44.61 
 
 
469 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  43.31 
 
 
457 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  44.62 
 
 
492 aa  349  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  46.84 
 
 
408 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  45.24 
 
 
437 aa  345  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  44.17 
 
 
521 aa  345  6e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  43.23 
 
 
498 aa  346  6e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  46.97 
 
 
452 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  43.41 
 
 
508 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  51.76 
 
 
634 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  44.5 
 
 
500 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  50.77 
 
 
477 aa  342  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  44.97 
 
 
452 aa  342  8e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  44.05 
 
 
437 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  44.12 
 
 
442 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  42.23 
 
 
488 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  46.59 
 
 
484 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  47.16 
 
 
638 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  50.46 
 
 
478 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
482 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  46.13 
 
 
513 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  45.65 
 
 
677 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1725  type II secretion system protein E  49.72 
 
 
465 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>