More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1742 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0173  tRNA pseudouridine synthase B  99.67 
 
 
321 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.016553  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1059  tRNA pseudouridine synthase B  99.67 
 
 
311 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00436099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1505  tRNA pseudouridine synthase B  99.67 
 
 
321 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0993  tRNA pseudouridine synthase B  99.67 
 
 
302 aa  590  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1764  tRNA pseudouridine synthase B  99.67 
 
 
302 aa  590  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1742  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00438072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1917  tRNA pseudouridine synthase B  99.67 
 
 
302 aa  590  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.274314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  93.71 
 
 
311 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  86 
 
 
310 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  85.23 
 
 
310 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  85.33 
 
 
310 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  80 
 
 
311 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  83.05 
 
 
310 aa  469  1e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  83.05 
 
 
310 aa  469  1e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  79.87 
 
 
311 aa  470  1e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  83.44 
 
 
322 aa  467  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  78.26 
 
 
309 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  82.37 
 
 
310 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  67.99 
 
 
314 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  67.76 
 
 
315 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  67.43 
 
 
314 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  67.21 
 
 
318 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  66.88 
 
 
318 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  60.26 
 
 
328 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  53.49 
 
 
305 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  53.16 
 
 
305 aa  307  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2136  tRNA pseudouridine synthase B  57.1 
 
 
338 aa  305  8e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0388744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0695  tRNA pseudouridine synthase B  56.67 
 
 
298 aa  305  8e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  52.49 
 
 
305 aa  303  2e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  55.37 
 
 
299 aa  302  4e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  51.83 
 
 
304 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  51.48 
 
 
306 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  51.5 
 
 
304 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  54.3 
 
 
339 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  51.83 
 
 
305 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  51.16 
 
 
305 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  51.16 
 
 
305 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  52.49 
 
 
305 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  50.66 
 
 
303 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  52.53 
 
 
302 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3381  tRNA pseudouridine synthase B  56.91 
 
 
332 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.092575  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  53.95 
 
 
337 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1919  pseudouridylate synthase  54.88 
 
 
345 aa  285  6e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1249  tRNA pseudouridine synthase B  56.21 
 
 
333 aa  284  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2992  tRNA pseudouridine synthase B  56.21 
 
 
321 aa  284  1e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10878  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  53.35 
 
 
307 aa  283  3e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1862  tRNA pseudouridine synthase B  49.34 
 
 
313 aa  283  3e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.552372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2750  tRNA pseudouridine synthase B  54.18 
 
 
318 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  58.69 
 
 
347 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  49.67 
 
 
302 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  52.58 
 
 
308 aa  275  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2559  tRNA pseudouridine synthase B  56.54 
 
 
333 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0116383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  51.96 
 
 
307 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  45.78 
 
 
318 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  48.39 
 
 
312 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  46.75 
 
 
324 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  47.02 
 
 
308 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  46.75 
 
 
324 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  46.75 
 
 
324 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  49.33 
 
 
308 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  48.68 
 
 
308 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2706  tRNA pseudouridine synthase B  47.08 
 
 
313 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  46.71 
 
 
309 aa  259  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1093  tRNA pseudouridine synthase B  46.35 
 
 
317 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0247742 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03394  tRNA pseudouridine synthase B  46.03 
 
 
314 aa  258  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  46.71 
 
 
309 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1028  tRNA pseudouridine synthase B  46.35 
 
 
317 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42961e-06 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2747  tRNA pseudouridine synthase B  52.3 
 
 
331 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0741734  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  46.1 
 
 
317 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  46.75 
 
 
318 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  46.1 
 
 
314 aa  255  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2832  tRNA pseudouridine synthase B  45.54 
 
 
318 aa  255  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.478015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  46.6 
 
 
323 aa  254  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3346  tRNA pseudouridine synthase B  48.01 
 
 
307 aa  254  1e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3058  tRNA pseudouridine synthase B  43.95 
 
 
315 aa  254  1e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.538597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2205  tRNA pseudouridine synthase B  45.37 
 
 
318 aa  254  1e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.344514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2825  tRNA pseudouridine synthase B  45.6 
 
 
315 aa  253  2e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.791691  hitchhiker  0.00423146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1697  tRNA pseudouridine synthase B  46.35 
 
 
317 aa  254  2e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0992  tRNA pseudouridine synthase B  45.08 
 
 
317 aa  253  2e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0963  tRNA pseudouridine synthase B  44.9 
 
 
315 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0397132  normal  0.0378785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  50.34 
 
 
293 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3387  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 
321 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448784 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  50.34 
 
 
293 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3559  tRNA pseudouridine synthase B  44.27 
 
 
317 aa  253  4e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  9.61174e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1032  tRNA pseudouridine synthase B  45.71 
 
 
317 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  hitchhiker  3.01922e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  45.78 
 
 
314 aa  252  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1009  tRNA pseudouridine synthase B  43.71 
 
 
317 aa  251  8e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3641  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 
314 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 
318 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  46.65 
 
 
318 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
314 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  45.45 
 
 
314 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
314 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
314 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
314 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
314 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3603  tRNA pseudouridine synthase B  46.1 
 
 
314 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  45.13 
 
 
314 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1130  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 
321 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346458  unclonable  6.26709e-12 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3579  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
314 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.911389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>