More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1704 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 
333 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 
301 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 
301 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 
301 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 
301 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  94.35 
 
 
555 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  79.12 
 
 
302 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  79.12 
 
 
302 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  79.12 
 
 
302 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  78.11 
 
 
301 aa  451  1e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  77.44 
 
 
301 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  68.01 
 
 
304 aa  407  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
303 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
314 aa  268  9e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
309 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
306 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
305 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
310 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41.41 
 
 
306 aa  235  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
298 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  45.14 
 
 
298 aa  234  2e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 
307 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 
307 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  45.14 
 
 
298 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
307 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
308 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
313 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2609  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
310 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379478  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
313 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
327 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
300 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
327 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
300 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
300 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
300 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
300 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
302 aa  222  5e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2745  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
310 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2720  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
310 aa  220  2e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2692  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
325 aa  220  2e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
327 aa  220  2e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
301 aa  221  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
309 aa  220  2e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 
308 aa  220  2e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
305 aa  221  2e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2080  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
325 aa  220  2e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0413  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
341 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.179367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
300 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1437  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.27 
 
 
293 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 
300 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  38.64 
 
 
311 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
313 aa  218  8e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  218  9e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  218  9e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0712  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
310 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
313 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  39 
 
 
302 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0606  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
310 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
296 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.62 
 
 
305 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
310 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
301 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
313 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3328  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 
327 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.125153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  40.73 
 
 
307 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0631  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
327 aa  215  6e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
298 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2359  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6020  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691555  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0891  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
297 aa  214  1e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6302  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
316 aa  214  1e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2439  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2719  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0227  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0726  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
310 aa  214  1e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1777  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
316 aa  214  1e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
306 aa  214  2e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1802  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
316 aa  213  3e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0497764  normal  0.412734 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  38.7 
 
 
307 aa  213  3e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 
295 aa  213  3e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 
335 aa  213  4e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
300 aa  213  4e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
324 aa  213  4e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
317 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
298 aa  211  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4216  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 
337 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
307 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
299 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
299 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 
318 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  43.11 
 
 
311 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
299 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
307 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1591  LysR family transcriptional regulator  45.94 
 
 
313 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>