More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1620 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0471  efflux system protein  94.74 
 
 		 514 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1798  hypothetical protein  94.73 
 
 		 569 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1620  Outer membrane protein  100 
 
 		 565 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6558  RND efflux system outer membrane lipoprotein  68.86 
 
 		 591 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  73.04 
 
 		 560 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1641  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  94.73 
 
 		 569 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1325  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  67.95 
 
 		 547 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324666  normal  0.0263416 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6272  RND efflux system outer membrane lipoprotein  72.82 
 
 		 558 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.397121 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1405  hypothetical protein  94.74 
 
 		 514 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6550  RND efflux system outer membrane lipoprotein  72.66 
 
 		 561 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5523  RND efflux system outer membrane lipoprotein  74.61 
 
 		 576 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1281  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  72.85 
 
 		 561 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.63 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.24 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.23 
 
 		 513 aa  349  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.2 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.89 
 
 		 515 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.57 
 
 		 500 aa  345  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.46 
 
 		 512 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.89 
 
 		 521 aa  333  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  38.51 
 
 		 479 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  39.16 
 
 		 479 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.17 
 
 		 533 aa  313  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.59 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.01 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.12 
 
 		 483 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.3 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  38.01 
 
 		 511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 		 483 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.03 
 
 		 484 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  38.08 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.03 
 
 		 484 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5243  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.82 
 
 		 537 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 512 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0563  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.87 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.72 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.332659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  34.7 
 
 		 489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  34.91 
 
 		 479 aa  283  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  37.28 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  35.93 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40 
 
 		 483 aa  273  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.42 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.28 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1737  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.33 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.87 
 
 		 501 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.22 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.33 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.85 
 
 		 470 aa  256  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2526  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.06 
 
 		 504 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  32.84 
 
 		 569 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.71 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.81 
 
 		 471 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.09 
 
 		 486 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.33 
 
 		 471 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.69 
 
 		 518 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.28 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0284  outer membrane efflux family protein  32.12 
 
 		 518 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  34.3 
 
 		 504 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.12 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  30.59 
 
 		 558 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1101  outer membrane protein  33.4 
 
 		 470 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2159  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.15 
 
 		 529 aa  231  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  35.38 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.46 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00901  multidrug resistance efflux pump protein  34.94 
 
 		 495 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 541 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1914  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.61 
 
 		 531 aa  227  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000272629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.78 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.47 
 
 		 546 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.65 
 
 		 489 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.78 
 
 		 480 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0630  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.31 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00465168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.67 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 462 aa  220  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  35.18 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.52 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.1 
 
 		 465 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.09 
 
 		 477 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.69 
 
 		 486 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.27 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  36.07 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.85 
 
 		 495 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0034  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.83 
 
 		 538 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.677331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.83 
 
 		 488 aa  213  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 495 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.82 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  29.59 
 
 		 483 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.02 
 
 		 495 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.02 
 
 		 495 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2582  hypothetical protein  27.59 
 
 		 520 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.44 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1404  hypothetical protein  89.47 
 
 		 152 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.71 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>