247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1614 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.72 
 
 
797 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  99.13 
 
 
810 aa  1588    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  52.76 
 
 
808 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  91.24 
 
 
766 aa  1346    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.46 
 
 
789 aa  654    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.15 
 
 
782 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  50 
 
 
790 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  98.98 
 
 
782 aa  1545    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  99.13 
 
 
803 aa  1588    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  100 
 
 
803 aa  1600    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  99.38 
 
 
803 aa  1592    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.11 
 
 
797 aa  735    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.78 
 
 
788 aa  670    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  49.3 
 
 
781 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50 
 
 
765 aa  739    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  50.58 
 
 
790 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  42.45 
 
 
815 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.82 
 
 
815 aa  635  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  42.56 
 
 
815 aa  632  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.67 
 
 
794 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.2 
 
 
786 aa  514  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  36.72 
 
 
804 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.34 
 
 
849 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  35.73 
 
 
786 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.86 
 
 
794 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  36.09 
 
 
842 aa  382  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  35.42 
 
 
766 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  35.45 
 
 
766 aa  366  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  35.32 
 
 
803 aa  364  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.46 
 
 
748 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  35.31 
 
 
984 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.7 
 
 
807 aa  361  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  34.7 
 
 
814 aa  361  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  35.06 
 
 
766 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  34.94 
 
 
766 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  34.94 
 
 
766 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.83 
 
 
816 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.84 
 
 
834 aa  347  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.92 
 
 
785 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  35.78 
 
 
783 aa  344  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.08 
 
 
775 aa  341  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.42 
 
 
790 aa  274  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.88 
 
 
791 aa  257  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.43 
 
 
754 aa  231  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  28.41 
 
 
778 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.08 
 
 
798 aa  205  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  25.46 
 
 
765 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  26.74 
 
 
788 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  25.46 
 
 
834 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.81 
 
 
734 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.27 
 
 
778 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.92 
 
 
778 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.4 
 
 
778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.62 
 
 
852 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.55 
 
 
866 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.15 
 
 
1040 aa  97.4  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.69 
 
 
837 aa  97.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  24.73 
 
 
850 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  24.73 
 
 
833 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  24.33 
 
 
833 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3835  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.91 
 
 
857 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.322059 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.18 
 
 
867 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  24.46 
 
 
833 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.56 
 
 
901 aa  88.2  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.74 
 
 
840 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.6 
 
 
880 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  24.63 
 
 
870 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0484781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.91 
 
 
878 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  22.42 
 
 
901 aa  85.9  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  22.91 
 
 
878 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  22.91 
 
 
878 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  24.5 
 
 
870 aa  84.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  24.5 
 
 
870 aa  84.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  22.64 
 
 
878 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  23.02 
 
 
863 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3391  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  20.69 
 
 
859 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  22.88 
 
 
856 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  24.23 
 
 
870 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  24.36 
 
 
870 aa  81.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  25.08 
 
 
939 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  24.01 
 
 
833 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.3 
 
 
867 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  23.4 
 
 
872 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  29.17 
 
 
840 aa  78.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.75 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  25.21 
 
 
869 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  25.21 
 
 
869 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  25.21 
 
 
869 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.57 
 
 
828 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.01 
 
 
890 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  25.21 
 
 
869 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  24.55 
 
 
914 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  24.55 
 
 
913 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.05 
 
 
856 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  24.31 
 
 
914 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.59 
 
 
861 aa  75.5  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  25 
 
 
842 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.04 
 
 
869 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  25.04 
 
 
869 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.34 
 
 
872 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>