77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1612 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  100 
 
 
174 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  323  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  99.4 
 
 
168 aa  323  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  323  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  99.4 
 
 
168 aa  323  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  92.53 
 
 
174 aa  298  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  43.24 
 
 
167 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  43.24 
 
 
167 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  41.89 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  42.94 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  41.38 
 
 
167 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  45.39 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  42.68 
 
 
186 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  42.68 
 
 
186 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  43.31 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  42.68 
 
 
186 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  42.04 
 
 
186 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  41.72 
 
 
190 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  42.04 
 
 
186 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  42.04 
 
 
186 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  36.18 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  35.53 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  39.61 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  37.91 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  38.75 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  42.76 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  40 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  33.99 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  41.78 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  33.1 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  39.43 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  35.85 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  33.12 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  34.93 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  30 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  31.54 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  33.55 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  32.7 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  32.09 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  31.29 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  32.93 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  32.93 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  33.96 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  33.96 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  33.56 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  33.96 
 
 
234 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  33.96 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  33.96 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  33.96 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  33.56 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  33.96 
 
 
234 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  33.96 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  32.88 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.47 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  31.82 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  36.36 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  31.79 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  38.56 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  35.35 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  30.38 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  30.38 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  32.21 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  28.57 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  33.7 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30.82 
 
 
339 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  33.55 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  28.03 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  27.78 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  27.17 
 
 
320 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  29.22 
 
 
184 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  29.22 
 
 
184 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  30.26 
 
 
228 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  27.03 
 
 
372 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  28.41 
 
 
331 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  27.48 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>