288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1176 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1176  ferredoxin  100 
 
 
290 aa  567  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1184  ferredoxin  99.31 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1023  ferredoxin  99.31 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0306  ferredoxin  99.31 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0842  ferredoxin  99.31 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.736914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1930  ferredoxin  98.97 
 
 
316 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1337  ferredoxin  98.97 
 
 
316 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  75.25 
 
 
306 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  73.2 
 
 
342 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  73.2 
 
 
342 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  73.33 
 
 
291 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  76.62 
 
 
279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  81.23 
 
 
320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  79.55 
 
 
334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  77.36 
 
 
341 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  87.54 
 
 
282 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  76.6 
 
 
339 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  79.5 
 
 
279 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  62.64 
 
 
276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0872  ferredoxin  62.41 
 
 
276 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1006  ferredoxin  62.02 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.110987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  63.29 
 
 
248 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  64.71 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0464  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  59.38 
 
 
228 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0463817  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1498  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.5 
 
 
230 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2376  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.76 
 
 
231 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.532877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.86 
 
 
212 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2064  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.48 
 
 
217 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.295108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.69 
 
 
259 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2170  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.28 
 
 
221 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.33 
 
 
216 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.33 
 
 
216 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3619  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  60.78 
 
 
238 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111565  normal  0.0672308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2341  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.49 
 
 
232 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0747882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2137  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.44 
 
 
214 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  60.93 
 
 
183 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  61.54 
 
 
188 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2487  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.97 
 
 
243 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2975  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.62 
 
 
224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  60.67 
 
 
178 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  47.74 
 
 
291 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.15 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2296  putative electron transport-related protein  63.04 
 
 
228 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.364932  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.35 
 
 
335 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  61.43 
 
 
180 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0273  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  63.7 
 
 
220 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.76 
 
 
194 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.8 
 
 
404 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  57.97 
 
 
193 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  59.71 
 
 
206 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  58.7 
 
 
188 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.25 
 
 
192 aa  169  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.34 
 
 
186 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  55.56 
 
 
198 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  57.35 
 
 
137 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.64 
 
 
209 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  47.78 
 
 
199 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  47.78 
 
 
199 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  52.2 
 
 
189 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  55.78 
 
 
192 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  52.56 
 
 
189 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  54.79 
 
 
205 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  48.82 
 
 
204 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  48.82 
 
 
204 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  48.82 
 
 
204 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  57.45 
 
 
199 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  51.92 
 
 
189 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.92 
 
 
189 aa  161  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  48.86 
 
 
193 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  50.31 
 
 
197 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  56.83 
 
 
198 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  51.25 
 
 
195 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  54.35 
 
 
190 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  48.86 
 
 
193 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  52.6 
 
 
189 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  48.86 
 
 
193 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  56.03 
 
 
189 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  54.17 
 
 
194 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  43.12 
 
 
204 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  58.7 
 
 
191 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  48.3 
 
 
193 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  52.38 
 
 
207 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  52.38 
 
 
207 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  57.69 
 
 
142 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  52.38 
 
 
188 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  58.02 
 
 
139 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  58.02 
 
 
139 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  55.03 
 
 
193 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  43.12 
 
 
204 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.13 
 
 
186 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  53.15 
 
 
191 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  39.57 
 
 
213 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  39.57 
 
 
213 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  51.41 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  51.41 
 
 
192 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  52.78 
 
 
196 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  51.41 
 
 
192 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>