178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1025 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1025  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  318  1e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000631398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1032  hypothetical protein  99.35 
 
 
153 aa  315  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1184  hypothetical protein  98.69 
 
 
170 aa  315  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2956  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  312  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.235784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1642  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  312  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2330  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  312  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0213902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0831  hypothetical protein  94.12 
 
 
170 aa  302  1e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2463  hypothetical protein  86.27 
 
 
153 aa  281  3e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.563467  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2458  hypothetical protein  86.27 
 
 
153 aa  281  3e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1847  hypothetical protein  86.27 
 
 
153 aa  281  3e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2375  hypothetical protein  86.27 
 
 
153 aa  280  4e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2507  hypothetical protein  86.27 
 
 
153 aa  280  4e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5789  hypothetical protein  84.97 
 
 
153 aa  277  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0836  hypothetical protein  82.35 
 
 
194 aa  270  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0992  protein of unknown function DUF55  80.79 
 
 
152 aa  260  5e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18186  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2217  hypothetical protein  79.74 
 
 
156 aa  257  5e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182603  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  76.97 
 
 
159 aa  243  1e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.495937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2670  protein of unknown function DUF55  74.34 
 
 
156 aa  236  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  76.16 
 
 
167 aa  236  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2403  hypothetical protein  74.17 
 
 
168 aa  235  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2212  protein of unknown function DUF55  74.34 
 
 
178 aa  234  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2834  hypothetical protein  72.85 
 
 
171 aa  227  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1663  protein of unknown function DUF55  70.67 
 
 
159 aa  225  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2092  hypothetical protein  69.33 
 
 
159 aa  220  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2927  hypothetical protein  67.55 
 
 
154 aa  218  2e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4934  protein of unknown function DUF55  68.67 
 
 
153 aa  217  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.455283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4026  hypothetical protein  67.76 
 
 
153 aa  216  9e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2669  hypothetical protein  67.33 
 
 
157 aa  215  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0614  hypothetical protein  65.99 
 
 
154 aa  210  4e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.78998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2674  hypothetical protein  65.56 
 
 
151 aa  210  5e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0126  hypothetical protein  62.25 
 
 
152 aa  202  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3972  hypothetical protein  62.33 
 
 
162 aa  197  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.766671  normal  0.0536087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3630  hypothetical protein  75.21 
 
 
124 aa  196  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3514  hypothetical protein  57.62 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  56.76 
 
 
153 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  3.52986e-05  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  56.76 
 
 
153 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  58.11 
 
 
153 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3282  protein of unknown function DUF55  62.42 
 
 
159 aa  184  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0784521  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2477  hypothetical protein  56.76 
 
 
153 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0301106  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  58.11 
 
 
152 aa  183  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  61.22 
 
 
156 aa  183  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  56.76 
 
 
153 aa  182  1e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  57.43 
 
 
153 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  57.43 
 
 
153 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  57.43 
 
 
153 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  56.76 
 
 
153 aa  182  2e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  59.73 
 
 
156 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01784  hypothetical protein  55.48 
 
 
182 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.280348  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  54.67 
 
 
156 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  60.4 
 
 
155 aa  171  4e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.63938e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  55.41 
 
 
155 aa  170  8e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  54.36 
 
 
158 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  54.48 
 
 
157 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3203  protein of unknown function DUF55  56 
 
 
153 aa  167  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0843  hypothetical protein  53.38 
 
 
155 aa  167  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2323  hypothetical protein  52.67 
 
 
155 aa  166  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  54.05 
 
 
154 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  56.08 
 
 
152 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2149  hypothetical protein  51.72 
 
 
149 aa  165  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  57.53 
 
 
152 aa  162  1e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00302  hypothetical protein  52.7 
 
 
156 aa  162  2e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  52.03 
 
 
152 aa  161  4e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  53.59 
 
 
152 aa  161  4e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  56.16 
 
 
152 aa  160  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  3.93887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  52.32 
 
 
155 aa  158  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  55.41 
 
 
154 aa  156  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  55.03 
 
 
165 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1030  protein of unknown function DUF55  53.33 
 
 
160 aa  154  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  52.35 
 
 
158 aa  153  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  52.03 
 
 
149 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  51.01 
 
 
149 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5031  hypothetical protein  50.68 
 
 
150 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  51.35 
 
 
149 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  50.34 
 
 
153 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  52.9 
 
 
150 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  50.33 
 
 
163 aa  147  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  50.68 
 
 
173 aa  146  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  50.67 
 
 
158 aa  145  1e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  50.68 
 
 
149 aa  145  2e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  53.69 
 
 
160 aa  145  2e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  145  2e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  52.7 
 
 
156 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0781  protein of unknown function DUF55  47.3 
 
 
154 aa  143  7e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0209669  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  50.34 
 
 
149 aa  143  8e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  50 
 
 
156 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  54.61 
 
 
151 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  51.41 
 
 
149 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  1.24301e-05  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  51.41 
 
 
149 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  48.67 
 
 
150 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  48.67 
 
 
150 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  50 
 
 
154 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1521  hypothetical protein  52.14 
 
 
152 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0365947  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15461  hypothetical protein  48 
 
 
156 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.439189  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2135  protein of unknown function DUF55  52.86 
 
 
151 aa  135  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  52.08 
 
 
155 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  45.95 
 
 
156 aa  135  3e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05161  hypothetical protein  51.45 
 
 
158 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16061  hypothetical protein  48.68 
 
 
155 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>