More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0971 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 
450 aa  883    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
449 aa  881    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  81.52 
 
 
460 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
449 aa  881    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  99.56 
 
 
450 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  83.06 
 
 
454 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 
450 aa  883    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  95.11 
 
 
450 aa  820    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 
450 aa  883    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  80.54 
 
 
462 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  81.52 
 
 
460 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  100 
 
 
450 aa  883    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  79.87 
 
 
461 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  82.37 
 
 
505 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  79.65 
 
 
461 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  68.9 
 
 
451 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  72.37 
 
 
451 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  68.22 
 
 
451 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  48.75 
 
 
457 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  48.02 
 
 
458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  49.76 
 
 
456 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  48.16 
 
 
457 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  48.25 
 
 
447 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  42.82 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  45.15 
 
 
420 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  39.28 
 
 
435 aa  259  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  40.81 
 
 
412 aa  257  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 
444 aa  256  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 
451 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  43.92 
 
 
427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 
429 aa  243  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  38.52 
 
 
426 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  40.62 
 
 
452 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  38.8 
 
 
437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  41 
 
 
422 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  37.96 
 
 
427 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  37.96 
 
 
427 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 
451 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  40.44 
 
 
322 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  34.86 
 
 
448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  38.13 
 
 
440 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 
437 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  40.25 
 
 
435 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  37.12 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  34.48 
 
 
432 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  37.46 
 
 
428 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  36.42 
 
 
475 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  33.78 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 
432 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  36.5 
 
 
321 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  36.14 
 
 
479 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 
298 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.78 
 
 
806 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 
299 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  33.46 
 
 
291 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 
840 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  34.19 
 
 
859 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 
844 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  32.93 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 
843 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.2 
 
 
1144 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  30.68 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  36.87 
 
 
864 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  28.45 
 
 
441 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 
861 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 
637 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  38.3 
 
 
842 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 
1105 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  33.08 
 
 
1111 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 
843 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
830 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.77 
 
 
796 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 
685 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  34.33 
 
 
784 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 
1166 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  39.89 
 
 
1128 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 
845 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.16 
 
 
825 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  25.77 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  36.45 
 
 
807 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  38.78 
 
 
1130 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 
832 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  40.2 
 
 
1110 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  34.62 
 
 
1110 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  33.86 
 
 
853 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  34.72 
 
 
1133 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  37.14 
 
 
1098 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 
877 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 
447 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  35.14 
 
 
1120 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  35.14 
 
 
1120 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  35.14 
 
 
1120 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 
862 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  31.68 
 
 
847 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 
847 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 
297 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  36.98 
 
 
1115 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>