More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0903 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  99.29 
 
 
918 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  100 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  100 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  99.65 
 
 
301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  97.16 
 
 
282 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  85.46 
 
 
282 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  85.82 
 
 
282 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  84.75 
 
 
282 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  87.23 
 
 
282 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  85.11 
 
 
282 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  84.75 
 
 
282 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  99.13 
 
 
229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  84.4 
 
 
282 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  72.24 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  73.4 
 
 
282 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  72.95 
 
 
282 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  60.64 
 
 
280 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  58.01 
 
 
310 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  56.14 
 
 
280 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  53.74 
 
 
281 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  53.02 
 
 
281 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  44.52 
 
 
302 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  45.51 
 
 
302 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  49.29 
 
 
280 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  43.52 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  43.19 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  41.06 
 
 
326 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  42.14 
 
 
314 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  39.6 
 
 
341 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  41.72 
 
 
295 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  38.89 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  40.97 
 
 
286 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  39.01 
 
 
287 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  42.01 
 
 
312 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  41.55 
 
 
302 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.03 
 
 
289 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.03 
 
 
289 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  41.49 
 
 
287 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  40.91 
 
 
289 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  42.66 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  39.44 
 
 
318 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  41.26 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  38.68 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  38.38 
 
 
302 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  41.55 
 
 
293 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  38.89 
 
 
330 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  38.89 
 
 
290 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  39.93 
 
 
324 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.32 
 
 
290 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  39.08 
 
 
317 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  38.68 
 
 
324 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  39.72 
 
 
274 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  38.33 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  36.65 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.62 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  38.11 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  37.19 
 
 
306 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  38.25 
 
 
302 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  37.5 
 
 
290 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  37.5 
 
 
290 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  37.24 
 
 
315 aa  168  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  37.15 
 
 
290 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  36.88 
 
 
286 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  37.76 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  35.69 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  34.3 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  38.65 
 
 
290 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.92 
 
 
277 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.46 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  36.33 
 
 
334 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  37.5 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  37.41 
 
 
324 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  39.02 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  37.68 
 
 
304 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  40.86 
 
 
285 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  37.54 
 
 
285 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  37 
 
 
336 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  38.87 
 
 
326 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  37.81 
 
 
303 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  36.71 
 
 
329 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  37.54 
 
 
320 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  37.81 
 
 
312 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  37.41 
 
 
304 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  38.79 
 
 
286 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  35.52 
 
 
303 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  34.4 
 
 
287 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  39.51 
 
 
306 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  36.36 
 
 
305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  36.39 
 
 
311 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  37.19 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  36.97 
 
 
304 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  40.07 
 
 
307 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  38.08 
 
 
286 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  36.97 
 
 
304 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  37.94 
 
 
282 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  38.23 
 
 
311 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  37.97 
 
 
302 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  36.5 
 
 
271 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  34.44 
 
 
286 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  36.27 
 
 
304 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>