More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0725 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  59.71 
 
 
494 aa  635  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  59.24 
 
 
502 aa  640  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  3.11367e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  66.26 
 
 
501 aa  666  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  61.09 
 
 
498 aa  668  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  89.8 
 
 
500 aa  935  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  60.76 
 
 
507 aa  644  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  61.87 
 
 
496 aa  664  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.69449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  60 
 
 
497 aa  657  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  60.76 
 
 
507 aa  644  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  63.21 
 
 
496 aa  676  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  60.76 
 
 
507 aa  644  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  59.92 
 
 
496 aa  650  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.15642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  63.62 
 
 
496 aa  675  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  90 
 
 
500 aa  932  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  89.2 
 
 
500 aa  928  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  59.71 
 
 
494 aa  636  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  62.35 
 
 
497 aa  658  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  100 
 
 
518 aa  1068  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  100 
 
 
518 aa  1068  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  100 
 
 
518 aa  1068  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  100 
 
 
518 aa  1068  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  100 
 
 
518 aa  1068  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  61.72 
 
 
501 aa  664  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  60.61 
 
 
502 aa  656  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  64.23 
 
 
496 aa  671  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  89.2 
 
 
500 aa  928  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  62.47 
 
 
496 aa  667  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.10223e-06  decreased coverage  9.61259e-09 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  62.07 
 
 
496 aa  665  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  60.84 
 
 
498 aa  639  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  62.15 
 
 
496 aa  645  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  62.55 
 
 
496 aa  643  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.99841e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  58.75 
 
 
503 aa  635  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  59.36 
 
 
503 aa  639  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  66.87 
 
 
496 aa  705  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  69.98 
 
 
513 aa  743  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5647e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  61.13 
 
 
496 aa  635  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  63.62 
 
 
505 aa  671  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  61.62 
 
 
497 aa  659  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  59.84 
 
 
501 aa  643  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  62.07 
 
 
496 aa  664  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.18027e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  89.8 
 
 
500 aa  932  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  85.92 
 
 
499 aa  908  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  60.61 
 
 
502 aa  654  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  87.12 
 
 
499 aa  914  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  60.97 
 
 
502 aa  659  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  60.97 
 
 
502 aa  659  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  60.97 
 
 
502 aa  659  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  61.17 
 
 
502 aa  660  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  60.97 
 
 
502 aa  659  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  62.07 
 
 
496 aa  665  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  58.91 
 
 
494 aa  635  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35699e-10 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  59.51 
 
 
520 aa  636  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  1.12542e-06  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  61.45 
 
 
510 aa  644  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  100 
 
 
503 aa  1035  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  68.22 
 
 
505 aa  710  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  61.87 
 
 
496 aa  663  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.62863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  62.07 
 
 
496 aa  665  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.37015e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  59.92 
 
 
494 aa  638  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  86.32 
 
 
499 aa  909  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  60.08 
 
 
510 aa  634  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.50114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  61.17 
 
 
498 aa  649  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  62.07 
 
 
496 aa  663  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  63.01 
 
 
496 aa  666  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  89.31 
 
 
505 aa  941  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  61.18 
 
 
516 aa  638  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  98 
 
 
500 aa  1013  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  62.07 
 
 
496 aa  663  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.30334e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  60.56 
 
 
502 aa  658  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  89.2 
 
 
500 aa  928  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  63.03 
 
 
497 aa  674  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  65.45 
 
 
496 aa  684  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.21066e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  100 
 
 
503 aa  1035  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  58.49 
 
 
495 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  59.51 
 
 
494 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  61.48 
 
 
494 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  59.51 
 
 
494 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  59.2 
 
 
498 aa  633  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  58.7 
 
 
494 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  57.95 
 
 
503 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  60.29 
 
 
501 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  58.5 
 
 
494 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  59.56 
 
 
504 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  58.49 
 
 
495 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52847e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  57.55 
 
 
503 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  58.95 
 
 
505 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  59.15 
 
 
505 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  58.3 
 
 
494 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  58.98 
 
 
495 aa  627  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  58.67 
 
 
505 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  60.16 
 
 
505 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  60.37 
 
 
494 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  60.7 
 
 
498 aa  626  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  60.4 
 
 
507 aa  627  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>