More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0713 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  100 
 
 
390 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
390 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  93.85 
 
 
390 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  99.49 
 
 
390 aa  733    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  99.74 
 
 
390 aa  735    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  84.43 
 
 
391 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  83.95 
 
 
391 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  81.59 
 
 
391 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  83.6 
 
 
416 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  83.6 
 
 
391 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  83.6 
 
 
391 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  82.49 
 
 
391 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  77.81 
 
 
388 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  79.37 
 
 
388 aa  567  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  79.1 
 
 
392 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  61.32 
 
 
389 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  61.32 
 
 
389 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  60.79 
 
 
389 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  60.79 
 
 
389 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  62.98 
 
 
389 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  62.47 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  62.72 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  61.32 
 
 
389 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  59.51 
 
 
388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  57.18 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  58.42 
 
 
388 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  58.9 
 
 
405 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  55.85 
 
 
408 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  57.61 
 
 
397 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  61.32 
 
 
393 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 
392 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  57.7 
 
 
388 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  56.3 
 
 
387 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  57.58 
 
 
389 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  57.42 
 
 
388 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  54.96 
 
 
388 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  54.05 
 
 
412 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  56.94 
 
 
385 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  53.89 
 
 
388 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  56.86 
 
 
384 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  57.67 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  57.67 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  57.67 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  54.74 
 
 
406 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  52.03 
 
 
391 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  53.81 
 
 
400 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  52.32 
 
 
406 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  53.79 
 
 
400 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  53.16 
 
 
400 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  53.16 
 
 
400 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  53.75 
 
 
400 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  56.58 
 
 
388 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  56.58 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  53.25 
 
 
400 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  51.27 
 
 
396 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  53.62 
 
 
391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  53.25 
 
 
400 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  51.52 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  54.64 
 
 
391 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  48.68 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  52.73 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  51.54 
 
 
378 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  49.87 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  49.61 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 
406 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.96 
 
 
388 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  49.61 
 
 
391 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  49.35 
 
 
391 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  53.01 
 
 
407 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 
400 aa  325  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  49.61 
 
 
391 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  51.45 
 
 
408 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  52.15 
 
 
404 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  53.03 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  52.86 
 
 
390 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 
391 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  55.39 
 
 
382 aa  316  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  51.72 
 
 
391 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  52.33 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  51.72 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  49.36 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  50.28 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  52.01 
 
 
395 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  50.56 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  51.3 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  49.22 
 
 
391 aa  312  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  51.27 
 
 
389 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  46.84 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  54.04 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  48.31 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  49.24 
 
 
397 aa  308  8e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>