More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0241 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  79.43 
 
 
430 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  85.42 
 
 
435 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  99.53 
 
 
430 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
430 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  99.52 
 
 
417 aa  810    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
430 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  99.77 
 
 
430 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  84.49 
 
 
435 aa  727    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  100 
 
 
430 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  77.14 
 
 
440 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  84.72 
 
 
435 aa  727    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  85.19 
 
 
435 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  95.58 
 
 
430 aa  799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  84.49 
 
 
435 aa  722    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  78.47 
 
 
430 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  84.72 
 
 
435 aa  727    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  85.42 
 
 
435 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  52.29 
 
 
443 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  53.62 
 
 
447 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 
443 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  50.12 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  52.11 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  54.23 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  53.25 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  50.97 
 
 
436 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  52.79 
 
 
461 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.19 
 
 
437 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  50.24 
 
 
436 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  51.17 
 
 
438 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  51.17 
 
 
438 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  50.7 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  50.12 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.46 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  50.24 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  50.72 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  50.61 
 
 
438 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  51.22 
 
 
438 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  49.38 
 
 
431 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  50.98 
 
 
438 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  51.08 
 
 
433 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  48.45 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  48.33 
 
 
425 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  50.38 
 
 
499 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  49.29 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  47.73 
 
 
425 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  48.33 
 
 
425 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  47.73 
 
 
425 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  47.73 
 
 
425 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  49.13 
 
 
427 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.56 
 
 
454 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.21 
 
 
425 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 
425 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  47.15 
 
 
442 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  47.8 
 
 
425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  46.53 
 
 
457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  47.33 
 
 
436 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 
427 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  48.48 
 
 
438 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  49.76 
 
 
428 aa  358  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  49.02 
 
 
428 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  48.78 
 
 
428 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  43.79 
 
 
443 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  48.54 
 
 
428 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  45.12 
 
 
431 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  43.85 
 
 
443 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  43.85 
 
 
443 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  43.85 
 
 
443 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  46.02 
 
 
437 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  43.49 
 
 
443 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
437 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  46.42 
 
 
437 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  43.26 
 
 
443 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  48.88 
 
 
428 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  47.98 
 
 
428 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  48.11 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1485  major facilitator transporter  48.88 
 
 
428 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  45.79 
 
 
428 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  43.41 
 
 
440 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 
433 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  44.04 
 
 
440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  46.73 
 
 
438 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.52 
 
 
440 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.52 
 
 
440 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  44.58 
 
 
440 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  43.28 
 
 
453 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
452 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  45.93 
 
 
437 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  44.87 
 
 
444 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  45.45 
 
 
445 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  45.91 
 
 
442 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
425 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  43.31 
 
 
432 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 
434 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 
439 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
434 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  44.66 
 
 
435 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 
439 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  45.21 
 
 
445 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  46 
 
 
438 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>