More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0148 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  99.08 
 
 		 434 aa  832    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  99.24 
 
 		 396 aa  756    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  99.31 
 
 		 434 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 434 aa  841    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  99.08 
 
 		 434 aa  832    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  90.78 
 
 		 433 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  99.24 
 
 		 396 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  99.77 
 
 		 434 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  57.8 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  59.27 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  59.48 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  60.66 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  59.06 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  59.29 
 
 		 422 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  60.42 
 
 		 389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  55.96 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3125  DNA protecting protein DprA  60.23 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  56.93 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  50.55 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  54.32 
 
 		 379 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  51.47 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  51.01 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  56.88 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  50.53 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  47.59 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  52.44 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  50.27 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  49.06 
 
 		 365 aa  293  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  47.42 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  49.22 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  47.39 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  48.78 
 
 		 358 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  47.63 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  47.31 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  50.82 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  47.75 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  48.94 
 
 		 379 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  46.77 
 
 		 386 aa  282  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  43.73 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  51.33 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  47.71 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43.95 
 
 		 377 aa  270  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  48.08 
 
 		 388 aa  270  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  46.24 
 
 		 364 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  47.79 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  47.79 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  44.84 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  46.77 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 379 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  43.29 
 
 		 405 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.16 
 
 		 369 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  44.59 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  42.52 
 
 		 361 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  45.72 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.39 
 
 		 308 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  45.16 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  45.37 
 
 		 338 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  45.37 
 
 		 338 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  45.39 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 369 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.21 
 
 		 361 aa  239  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 338 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  48.05 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  47.95 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.98 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  42.82 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  43.91 
 
 		 338 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  34.88 
 
 		 362 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.6 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  43.59 
 
 		 338 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  47.51 
 
 		 365 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  44.3 
 
 		 340 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.61 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  43.59 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  43.59 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.55 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 389 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  42.77 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  47.18 
 
 		 365 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.11 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  46.18 
 
 		 365 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  45.81 
 
 		 365 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 377 aa  226  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  45.34 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.38 
 
 		 356 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  45.34 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  39.2 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  48.48 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  43.61 
 
 		 338 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  48 
 
 		 366 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  57.53 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>