More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0061 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0060  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0276  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0061  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2660  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.62 
 
 
265 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1834  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.62 
 
 
265 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2718  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.62 
 
 
265 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3293  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.62 
 
 
265 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0053  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  97.36 
 
 
265 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
263 aa  271  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.052373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0928  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
263 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
263 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
263 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.526746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
263 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
263 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0533627  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
260 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  39.84 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
271 aa  161  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 
258 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
254 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
264 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
254 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
251 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
254 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
260 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
255 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.27 
 
 
252 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
252 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 
254 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
278 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
248 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
269 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
247 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
254 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
248 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
253 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.361501  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  38.58 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
268 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 
263 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
263 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  37.4 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
253 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
258 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
257 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
256 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 
254 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
266 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.74 
 
 
266 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 
255 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
254 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.19 
 
 
272 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
261 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
258 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
253 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
257 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
249 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  35.02 
 
 
256 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.07 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.74 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0816082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.68 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  36.47 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 
249 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
254 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
261 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
259 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
254 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6202  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.68 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.554491 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>