More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0056 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 292 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  99.66 
 
 		 292 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 		 292 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 		 292 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  99.32 
 
 		 292 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 		 292 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  99.24 
 
 		 264 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  94.32 
 
 		 264 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  57.55 
 
 		 288 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 741 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2538  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 772 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1174  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  30.58 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  28.72 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 704 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.89 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.3 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 908 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.01 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  32.19 
 
 		 956 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2113  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4486  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 661 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  26.77 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.04 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43770  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.150883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.35 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0251  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.477771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  30.1 
 
 		 898 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.08 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  26.74 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  30.13 
 
 		 924 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  26.67 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 697 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  27.74 
 
 		 940 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  25.87 
 
 		 542 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.44 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  27.84 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.28 
 
 		 989 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  28 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>