28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0037 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0037  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0250  hypothetical protein  98.27 
 
 
173 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0037  hypothetical protein  98.27 
 
 
173 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2696  hypothetical protein  97.11 
 
 
173 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3271  hypothetical protein  97.11 
 
 
173 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1856  hypothetical protein  97.11 
 
 
173 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1716  hypothetical protein  64 
 
 
167 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4463  hypothetical protein  67.83 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0446649  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01185  hypothetical protein  55.63 
 
 
161 aa  174  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0422  hypothetical protein  59.72 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1906  hypothetical protein  61.27 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74595  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4129  hypothetical protein  61.11 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402697  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4237  hypothetical protein  61.11 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3390  hypothetical protein  60.42 
 
 
165 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3348  hypothetical protein  51.32 
 
 
163 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2683  hypothetical protein  59.86 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570135  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2903  hypothetical protein  51.66 
 
 
167 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000247  permease  48.32 
 
 
167 aa  147  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3588  hypothetical protein  51.32 
 
 
161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1681  hypothetical protein  41.78 
 
 
159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3836  hypothetical protein  51.03 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1862  hypothetical protein  41.78 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588861  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4272  hypothetical protein  49.66 
 
 
185 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1596  hypothetical protein  50.34 
 
 
162 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00090  predicted membrane protein  35.33 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3769  hypothetical protein  35.62 
 
 
165 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1783  hypothetical protein  41.61 
 
 
163 aa  91.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119628  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3786  hypothetical protein  32.68 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0426513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>