46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0018 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  100 
 
 
175 aa  333  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  100 
 
 
168 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  100 
 
 
168 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  99.4 
 
 
168 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  99.4 
 
 
168 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  99.4 
 
 
168 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  99.4 
 
 
175 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  98.81 
 
 
168 aa  330  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  79.17 
 
 
168 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  80.36 
 
 
168 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  76.79 
 
 
168 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  78.57 
 
 
168 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  78.57 
 
 
168 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  77.38 
 
 
168 aa  266  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  76.79 
 
 
168 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  69.51 
 
 
167 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  74.36 
 
 
167 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  70.12 
 
 
167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  43.48 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  41.14 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  40.62 
 
 
188 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  41.03 
 
 
189 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  41.03 
 
 
189 aa  97.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  32.32 
 
 
174 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  24.81 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  24.81 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  24.81 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  24.81 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  24.22 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  27.04 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  24.62 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  27.44 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  26.05 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  25.2 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  25.58 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  29.86 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  27.67 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  23.44 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  25 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  24.18 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  24.81 
 
 
158 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  25 
 
 
158 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  24 
 
 
178 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  24.53 
 
 
162 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  24.24 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  24.67 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>