89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0016 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  99.76 
 
 
416 aa  825    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  99.76 
 
 
416 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  99.73 
 
 
372 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  90.89 
 
 
417 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  99.52 
 
 
416 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  100 
 
 
416 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  99.76 
 
 
416 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  99.52 
 
 
416 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  78.9 
 
 
373 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  76.04 
 
 
373 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  79.89 
 
 
375 aa  554  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  77.99 
 
 
374 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  78.3 
 
 
369 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  78.3 
 
 
369 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  78.3 
 
 
369 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  66.32 
 
 
431 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  64.42 
 
 
577 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  68.65 
 
 
367 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  42.74 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  41.78 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  43.18 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3048  General secretion pathway protein K  41.23 
 
 
362 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369942  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3110  general secretory pathway K transmembrane protein  43.66 
 
 
352 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625558  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  37.22 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  38.08 
 
 
331 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  34.66 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0760  general secretion pathway protein K  33.05 
 
 
343 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749309  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  34.56 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  32.66 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  34.84 
 
 
338 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1325  general secretion pathway protein K  32.84 
 
 
314 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  31.36 
 
 
321 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  32.67 
 
 
325 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0921  general secretion pathway protein K  32.87 
 
 
357 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0538  general secretion pathway protein K  30.7 
 
 
325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0671  general secretion pathway protein K  32.12 
 
 
381 aa  130  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0650  general secretion pathway protein K  32.25 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00867804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  31.36 
 
 
317 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.89 
 
 
320 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  30.6 
 
 
304 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  27.52 
 
 
324 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  30.67 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  27.13 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.8 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2214  General secretion pathway protein K  26.98 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  24.51 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  27.92 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  27.87 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  27.61 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  25.5 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  25.79 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  25.93 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  26.86 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  24.52 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  25.79 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  25.79 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  25.79 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  24.79 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  28.66 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  24.79 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 
332 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  23.86 
 
 
332 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  25.71 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  22.22 
 
 
327 aa  64.3  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
333 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  27.46 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  27.11 
 
 
292 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  26.07 
 
 
328 aa  57  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  24.8 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  20.9 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  22.68 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  26.9 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  27.65 
 
 
272 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0735  putative general secretory pathway protein K  28.12 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  27 
 
 
328 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  25.57 
 
 
328 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  23.42 
 
 
356 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  25.2 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  28.71 
 
 
322 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  62.86 
 
 
658 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  24.91 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  36.61 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  25.25 
 
 
299 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  23 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3003  putative general secretory pathway protein K  42.31 
 
 
313 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  34.82 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3024  Type II secretory pathway component PulK-like protein  40.58 
 
 
297 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>