More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2603 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  91.77 
 
 		 243 aa  443  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6684  LytR/AlgR family transcriptional regulator  79.01 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1458  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 140 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1373  DNA-binding response regulator  95 
 
 		 300 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.648551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  48.79 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0192  response regulator  99.01 
 
 		 101 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0468  response regulator  99.01 
 
 		 101 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1459  response regulator  99.01 
 
 		 101 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0193  response regulator  100 
 
 		 108 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0469  alginate biosynthesis regulatory protein  100 
 
 		 108 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.901816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.61 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.73 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  39.23 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  39.11 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  41.57 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.56 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.51 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  43.02 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3546  LytR/AlgR family transcriptional regulator  78.5 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  40.88 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.28 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  40 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  42.49 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  33.58 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  36.86 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  36.08 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  34.73 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  36.08 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.33 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.53 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  35.29 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.7 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  36.08 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 276 aa  118  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  37.02 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  33.78 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  32.34 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.8 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.23 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  32.88 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.86 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.13 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.76 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  32.62 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3175  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.64 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0217  LytTr DNA-binding region  31.58 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3790  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.19 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540237  normal  0.0384587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.47 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  32.36 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  32.91 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  35 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.94 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  34.12 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.08 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.49 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4710  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.98 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  32.24 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.08 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.64 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2452  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.51 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0310324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.95 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.78 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  31.8 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.53 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47610  encystment and alginate biosynthesis response regulator; AlgR  32.4 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  35.98 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  29.39 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.21 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.55 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  29.88 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  33.2 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1679  LytTR family two component transcriptional regulator  27.92 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  30.94 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.94 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  30.94 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>