More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2539 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  99.77 
 
 
442 aa  877    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  82.43 
 
 
444 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  99.77 
 
 
442 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  99.77 
 
 
442 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  100 
 
 
442 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  99.77 
 
 
442 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  81.76 
 
 
444 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  93.81 
 
 
436 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  82.21 
 
 
444 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  73.54 
 
 
446 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  76.68 
 
 
446 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  73.32 
 
 
446 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  81.98 
 
 
444 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  99.77 
 
 
442 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  81.76 
 
 
455 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  81.98 
 
 
444 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  99.55 
 
 
442 aa  875    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  36.01 
 
 
442 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.89 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 
447 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
442 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
442 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
447 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
442 aa  243  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
441 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  35.96 
 
 
443 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
430 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 
423 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
445 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  32.89 
 
 
460 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 
431 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
439 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
443 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
451 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
443 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
430 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 
444 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
431 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
441 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
441 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
441 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
441 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
441 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
441 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
441 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  31.57 
 
 
445 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
466 aa  200  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
441 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
441 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
442 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
441 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  31.68 
 
 
441 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
395 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
390 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
471 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
388 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
378 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
385 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
390 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  28.81 
 
 
390 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
387 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
382 aa  136  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
394 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
385 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
383 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.17 
 
 
386 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
393 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
386 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
382 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
394 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
373 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
377 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
983 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
500 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.6 
 
 
377 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.34 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
984 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
385 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>