More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2498 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  96.48 
 
 		 284 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 285 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 285 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  83.51 
 
 		 285 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  82.39 
 
 		 284 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  81.4 
 
 		 285 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  81.75 
 
 		 285 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  81.4 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 286 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 294 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  71.93 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  66.3 
 
 		 298 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  65.8 
 
 		 314 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 		 310 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 314 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 297 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  62.87 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 316 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 316 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 316 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 316 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 324 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  53.91 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  53.91 
 
 		 275 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 278 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  54.02 
 
 		 274 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  53.17 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.5 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.12 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.12 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  35.19 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  33.07 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  34.53 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  30.65 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.84 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.89 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  32.96 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.67 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  25 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>