More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2464 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1367  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0940  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2464  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.893571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0352  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0631  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343147  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1197  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  99.28 
 
 
277 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1271  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  99.28 
 
 
277 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346222  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1539  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  92.42 
 
 
276 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0903  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  74.35 
 
 
269 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4703  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.98 
 
 
269 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5482  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.23 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3566  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.23 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102569  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4801  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.23 
 
 
269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.996441  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4181  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.98 
 
 
269 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.220701  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.86 
 
 
269 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503149  hitchhiker  0.00343505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0623  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.67 
 
 
260 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.08 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.31 
 
 
253 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5308  dehydrogenase  44.88 
 
 
256 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
259 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0536617  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.36 
 
 
258 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
258 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
259 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
251 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1235  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 
259 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183265  normal  0.0279411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0179  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
259 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0190  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
259 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0199  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
259 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
248 aa  169  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3017  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.31 
 
 
263 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0666  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
231 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.948597  decreased coverage  0.000102721 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.43 
 
 
251 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
264 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
264 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
264 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
248 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
250 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.04 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.83 
 
 
245 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
247 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  34.51 
 
 
262 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
248 aa  153  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
246 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  37.01 
 
 
257 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
246 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
263 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
263 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
263 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
263 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
263 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
256 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
245 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
246 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
246 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
246 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  35.83 
 
 
256 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.11 
 
 
248 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
246 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
251 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  34.48 
 
 
259 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  34.62 
 
 
258 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
246 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.2 
 
 
248 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
259 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
246 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
263 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  43.2 
 
 
261 aa  148  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  34.24 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  38.65 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  35.61 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  34.24 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  34.63 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  35.25 
 
 
254 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.94 
 
 
247 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
247 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.06 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
234 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.283479  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  37.35 
 
 
257 aa  145  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0087  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.27 
 
 
246 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>