More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2302 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  71.84 
 
 		 488 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  98.8 
 
 		 498 aa  967    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  99 
 
 		 502 aa  979    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  99 
 
 		 502 aa  979    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  99.2 
 
 		 502 aa  981    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  100 
 
 		 502 aa  986    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  99 
 
 		 502 aa  979    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  94.89 
 
 		 502 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  99.2 
 
 		 511 aa  981    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  69.8 
 
 		 489 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 492 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  65.17 
 
 		 492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  54.47 
 
 		 495 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  52.75 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 488 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51.08 
 
 		 491 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.7 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  50.54 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.48 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 569 aa  359  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  46.01 
 
 		 502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  46.11 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  45.57 
 
 		 502 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  47.84 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.28 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.43 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 492 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.74 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 515 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.75 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.43 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  42.34 
 
 		 509 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  42.89 
 
 		 520 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.39 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 501 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.38 
 
 		 507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  42.33 
 
 		 511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 507 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 506 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 507 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 507 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 495 aa  336  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 564 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  44.4 
 
 		 561 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 546 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 564 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.72 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 506 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 523 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 507 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 488 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  42.27 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 562 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.5 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  39 
 
 		 521 aa  326  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  44.2 
 
 		 564 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 564 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 470 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  40.93 
 
 		 502 aa  297  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 492 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 501 aa  296  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 492 aa  293  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.18 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.88 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 517 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.32 
 
 		 488 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>