275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2171 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  99.29 
 
 
283 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  98.94 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  50.19 
 
 
296 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  46.18 
 
 
285 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.11 
 
 
288 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  33.92 
 
 
290 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  34.16 
 
 
299 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  35.23 
 
 
295 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21330  Taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  35.96 
 
 
338 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.74 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  33.81 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  33.81 
 
 
299 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
299 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  34.02 
 
 
302 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  36.73 
 
 
291 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  33.22 
 
 
308 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  36 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  35.64 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  35.64 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  36 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  35.64 
 
 
308 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  35.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  35.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  35.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  35.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  35.21 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  35.21 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
302 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  34.24 
 
 
305 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  34.18 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  34.27 
 
 
299 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
301 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  34.15 
 
 
300 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  32.3 
 
 
298 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  31.27 
 
 
273 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  32.03 
 
 
287 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  32.61 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  32.61 
 
 
300 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  31.62 
 
 
298 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.47 
 
 
284 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  31.88 
 
 
299 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  34.15 
 
 
267 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  32.38 
 
 
264 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  31.9 
 
 
264 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  28.97 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.11 
 
 
287 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  27.9 
 
 
281 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  27.54 
 
 
327 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  27.54 
 
 
327 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.42 
 
 
293 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  28.67 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  30.93 
 
 
335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  31.56 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  32.12 
 
 
293 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.16 
 
 
287 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  27.17 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  29.45 
 
 
278 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  30.07 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  30.53 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  31.21 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  28.35 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  30.42 
 
 
315 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  30 
 
 
315 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6017  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.37 
 
 
301 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  30.43 
 
 
272 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  30.03 
 
 
315 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  30.8 
 
 
289 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  30.93 
 
 
316 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.57 
 
 
301 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.27 
 
 
301 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  29.08 
 
 
277 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.28 
 
 
278 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  29.58 
 
 
318 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  30.89 
 
 
277 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  33.52 
 
 
282 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  29.72 
 
 
315 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  26.67 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  32.78 
 
 
282 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.42 
 
 
305 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  32.78 
 
 
282 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  32.78 
 
 
282 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  34.25 
 
 
307 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  28.72 
 
 
277 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.77 
 
 
321 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.34 
 
 
281 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  26.85 
 
 
270 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  29.69 
 
 
315 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  29.86 
 
 
276 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  30.07 
 
 
281 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  29.69 
 
 
315 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.01 
 
 
282 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  25.25 
 
 
289 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  28.47 
 
 
315 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  27.21 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  29.43 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  32.07 
 
 
283 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  32.07 
 
 
283 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  32.07 
 
 
283 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  28.47 
 
 
282 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>