44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2146 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  98.02 
 
 		 101 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  98.02 
 
 		 101 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  91.09 
 
 		 101 aa  190  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  84.16 
 
 		 101 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  84.16 
 
 		 101 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  84.16 
 
 		 101 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  82.18 
 
 		 101 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09220  isochorismate-pyruvate lyase  69.31 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119967  normal  0.746406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0870  isochorismate-pyruvate lyase  68.32 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  51 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  47.37 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  41.76 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  41.76 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3009  chorismate mutase related enzymes  48.98 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0745202  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  37.5 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  31.91 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  34.69 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  38.46 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.93 
 
 		 475 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  31.63 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  31.11 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  27.84 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  27.96 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  25 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  37.35 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  30.43 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  33.75 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  34.21 
 
 		 359 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  33.33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  30.59 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  31.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  27.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  31.33 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  26.6 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  32.94 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  31.87 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  29.79 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  29.17 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  29.79 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  30.59 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  27.06 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 		 377 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.1 
 
 		 372 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>