263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1791 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  70.27 
 
 
149 aa  209  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  63.51 
 
 
157 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  62.91 
 
 
148 aa  180  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  63.95 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  58.74 
 
 
153 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  60.81 
 
 
157 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  63.51 
 
 
166 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  56.76 
 
 
152 aa  175  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  61.15 
 
 
159 aa  174  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  55.41 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  54.42 
 
 
152 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  59.06 
 
 
149 aa  168  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  53.74 
 
 
152 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  55.1 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  57.14 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  51.01 
 
 
149 aa  157  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  51.01 
 
 
149 aa  157  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  51.68 
 
 
152 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  55.24 
 
 
148 aa  154  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  54.05 
 
 
149 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  55.63 
 
 
181 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.65 
 
 
149 aa  150  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  48.32 
 
 
149 aa  150  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  57.64 
 
 
145 aa  148  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  53.02 
 
 
149 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  58.33 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  51.02 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  50 
 
 
322 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  50.34 
 
 
149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
158 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  48.34 
 
 
156 aa  140  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.3 
 
 
149 aa  140  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  48.32 
 
 
148 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  48.34 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 
370 aa  138  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  48.3 
 
 
158 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  48.32 
 
 
152 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  48.67 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  48.67 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  48.67 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
163 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  46.26 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.26 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  48.99 
 
 
156 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  50.67 
 
 
151 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
149 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
149 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  46.62 
 
 
149 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
149 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  45.27 
 
 
157 aa  133  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  46.62 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  47.62 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  48.67 
 
 
152 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  44.9 
 
 
162 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.25 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.44 
 
 
163 aa  130  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  48.67 
 
 
151 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  48.67 
 
 
151 aa  130  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  43.54 
 
 
149 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.58 
 
 
145 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.15 
 
 
146 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.26 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  43.62 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  51.39 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  43.62 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  43.62 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  43.62 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  47.33 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  41.22 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  42.95 
 
 
147 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  45.03 
 
 
147 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  42.95 
 
 
147 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.92 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  46.62 
 
 
156 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  44.67 
 
 
169 aa  124  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  42.28 
 
 
147 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  44.97 
 
 
149 aa  124  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  42.28 
 
 
147 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  46.62 
 
 
152 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1171  ribose 5-phosphate isomerase B  40 
 
 
148 aa  123  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0563702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.78 
 
 
149 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  41.61 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  43.05 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  47.97 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  46.15 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  43.42 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.5 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  46.15 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.28 
 
 
151 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.76 
 
 
142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>