158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1689 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  43.16 
 
 		 1302 aa  993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  45 
 
 		 1289 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  45.23 
 
 		 1289 aa  1023    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  67.9 
 
 		 1366 aa  1744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  45.23 
 
 		 1289 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  46.99 
 
 		 1302 aa  1128    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  100 
 
 		 1358 aa  2703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  52.49 
 
 		 1317 aa  1252    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  67.87 
 
 		 1369 aa  1797    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  54.75 
 
 		 1332 aa  1307    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  46.92 
 
 		 1302 aa  1110    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  69.49 
 
 		 1365 aa  1820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  69.25 
 
 		 1348 aa  1822    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  68.88 
 
 		 1365 aa  1817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  47.7 
 
 		 1268 aa  1157    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  66.22 
 
 		 1329 aa  1729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  99.43 
 
 		 890 aa  1722    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  99.54 
 
 		 431 aa  866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  99.43 
 
 		 890 aa  1722    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  99.54 
 
 		 431 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  47.06 
 
 		 1302 aa  1129    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  99.71 
 
 		 1358 aa  2694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  46.99 
 
 		 1302 aa  1129    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  99.41 
 
 		 1358 aa  2685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  45.3 
 
 		 1289 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  44.58 
 
 		 1302 aa  1073    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  34.21 
 
 		 1211 aa  631  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  34.74 
 
 		 1209 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1208 aa  602  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1205 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  34.79 
 
 		 1209 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  34.79 
 
 		 1209 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  34.79 
 
 		 1209 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  34.79 
 
 		 1209 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  34.74 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  32.55 
 
 		 1209 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  34.74 
 
 		 1209 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  34.74 
 
 		 1209 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  33.59 
 
 		 1218 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1275 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  31.53 
 
 		 1275 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  35.02 
 
 		 1199 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  30.04 
 
 		 1212 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  34.47 
 
 		 1220 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  29.81 
 
 		 1171 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1176 aa  492  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  31.61 
 
 		 1150 aa  479  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  29.69 
 
 		 1207 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1102 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.77 
 
 		 1182 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.49 
 
 		 1176 aa  358  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  29.03 
 
 		 1175 aa  357  8.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  27.43 
 
 		 1181 aa  346  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  26.41 
 
 		 1172 aa  338  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.73 
 
 		 1173 aa  337  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1173 aa  336  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1181 aa  290  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.42 
 
 		 1148 aa  281  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.23 
 
 		 1187 aa  266  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.85 
 
 		 1182 aa  264  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  27.96 
 
 		 1152 aa  258  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.46 
 
 		 1164 aa  248  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1192 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1008 aa  234  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1164 aa  232  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  28.21 
 
 		 1164 aa  231  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1208 aa  230  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1168 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  25.57 
 
 		 1179 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.86 
 
 		 1194 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1206 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  24.73 
 
 		 1206 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1147 aa  205  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1167 aa  205  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1167 aa  205  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1167 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1167 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1104 aa  204  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  27.13 
 
 		 728 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  26.83 
 
 		 1164 aa  201  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  26.59 
 
 		 1157 aa  198  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 1194 aa  196  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  22.54 
 
 		 1165 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1179 aa  184  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  21.92 
 
 		 1177 aa  183  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  21.92 
 
 		 1177 aa  183  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  34.55 
 
 		 1204 aa  181  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  22 
 
 		 1165 aa  181  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.02 
 
 		 1165 aa  177  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  25.68 
 
 		 1205 aa  176  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1270 aa  165  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  165  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1297 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.66 
 
 		 1230 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1195 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>