More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1660 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1660  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1943  hypothetical protein  97.13 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366238  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1247  hypothetical protein  97.13 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.127148  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0960  hypothetical protein  97.13 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2222  hypothetical protein  97.13 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0293  outer membrane porin OpcP  96.17 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  81.25 
 
 		 382 aa  337  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  62.44 
 
 		 386 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  51.21 
 
 		 391 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  47.14 
 
 		 384 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  46.15 
 
 		 389 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  46.15 
 
 		 389 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0203  porin domain-containing protein  94.74 
 
 		 95 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  45.67 
 
 		 389 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  47.14 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  47.14 
 
 		 382 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.06 
 
 		 383 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.71 
 
 		 381 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  41.75 
 
 		 380 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  38.78 
 
 		 383 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  38.16 
 
 		 384 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  39.61 
 
 		 383 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  36.89 
 
 		 384 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  36.89 
 
 		 384 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  36.89 
 
 		 384 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  38.83 
 
 		 381 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  36.53 
 
 		 396 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  36.99 
 
 		 394 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  36.06 
 
 		 414 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  36.41 
 
 		 384 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  36.89 
 
 		 384 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  34.78 
 
 		 383 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  35.92 
 
 		 384 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  36.53 
 
 		 394 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  37.68 
 
 		 382 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  36.54 
 
 		 386 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  34.63 
 
 		 385 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.86 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6021  porin  37.38 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  36.23 
 
 		 386 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.71 
 
 		 383 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  36.15 
 
 		 376 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  38.46 
 
 		 375 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.82 
 
 		 375 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  36.36 
 
 		 379 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  35.12 
 
 		 377 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.65 
 
 		 375 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.65 
 
 		 375 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  37.14 
 
 		 383 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  35.62 
 
 		 391 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  35.16 
 
 		 409 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  35.16 
 
 		 409 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  32.86 
 
 		 383 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  32.86 
 
 		 374 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  32.86 
 
 		 383 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  33.49 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  33.49 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  33.49 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.79 
 
 		 384 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  33.49 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  37.13 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  33.49 
 
 		 379 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  35.94 
 
 		 403 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  33.49 
 
 		 379 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  35.94 
 
 		 471 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  35.02 
 
 		 418 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.65 
 
 		 387 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  33.64 
 
 		 398 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  33.64 
 
 		 403 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  33.64 
 
 		 403 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  34.56 
 
 		 418 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  32.54 
 
 		 379 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  33.33 
 
 		 386 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  34.7 
 
 		 381 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1124  OmpC family outer membrane porin  34.43 
 
 		 395 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  35 
 
 		 386 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 386 aa  92  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  34.46 
 
 		 380 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  34.46 
 
 		 380 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  33.33 
 
 		 380 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  35.39 
 
 		 384 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  35.16 
 
 		 381 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  33.49 
 
 		 383 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  28.57 
 
 		 385 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  35.39 
 
 		 384 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  33.7 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  31.05 
 
 		 394 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>