More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1600 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  62.56 
 
 		 930 aa  1125    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  65.21 
 
 		 856 aa  1120    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  45.13 
 
 		 884 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  100 
 
 		 913 aa  1851    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  92.11 
 
 		 939 aa  1709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  99.56 
 
 		 914 aa  1844    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  99.67 
 
 		 914 aa  1845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.22 
 
 		 880 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.06 
 
 		 886 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.79 
 
 		 861 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  40.05 
 
 		 901 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  40.17 
 
 		 901 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.08 
 
 		 850 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.18 
 
 		 867 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.37 
 
 		 852 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.38 
 
 		 872 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.44 
 
 		 852 aa  572  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.37 
 
 		 890 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  39.48 
 
 		 833 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.85 
 
 		 866 aa  562  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.26 
 
 		 865 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  36.79 
 
 		 866 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  36.79 
 
 		 861 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  37.62 
 
 		 888 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  36.79 
 
 		 866 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  39.05 
 
 		 870 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.05 
 
 		 870 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  37.65 
 
 		 866 aa  532  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.81 
 
 		 880 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.7 
 
 		 1040 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.71 
 
 		 866 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  37.13 
 
 		 866 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.61 
 
 		 887 aa  522  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.12 
 
 		 851 aa  522  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.02 
 
 		 963 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  38.84 
 
 		 842 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  37.62 
 
 		 844 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  37.09 
 
 		 866 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  36.2 
 
 		 865 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  36.07 
 
 		 866 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  36.5 
 
 		 868 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  38.37 
 
 		 850 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2031  outer membrane usher protein YcbS  38.25 
 
 		 833 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617204  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2231  outer membrane usher protein  37.8 
 
 		 833 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2088  fimbrial usher protein  37.68 
 
 		 833 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  36.56 
 
 		 872 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  35.09 
 
 		 863 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  34.98 
 
 		 878 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  33.45 
 
 		 883 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  35.28 
 
 		 854 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  34.98 
 
 		 878 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  34.86 
 
 		 856 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.56 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.86 
 
 		 878 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  35.28 
 
 		 854 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  34.98 
 
 		 878 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.28 
 
 		 863 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.22 
 
 		 871 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  33.22 
 
 		 875 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.84 
 
 		 838 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  34.71 
 
 		 838 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  34.71 
 
 		 838 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  34.59 
 
 		 863 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  34.71 
 
 		 838 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.46 
 
 		 838 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  34.46 
 
 		 838 aa  446  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.87 
 
 		 929 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.72 
 
 		 852 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.38 
 
 		 875 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.38 
 
 		 875 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  33.61 
 
 		 869 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  33.37 
 
 		 869 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.68 
 
 		 867 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  33.49 
 
 		 869 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  33.37 
 
 		 869 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.67 
 
 		 833 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.37 
 
 		 869 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  33.29 
 
 		 842 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  34.04 
 
 		 853 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.08 
 
 		 877 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2450  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.16 
 
 		 851 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  33.92 
 
 		 853 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  33.29 
 
 		 842 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  33.92 
 
 		 853 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  33.8 
 
 		 853 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  33.14 
 
 		 869 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  34.07 
 
 		 853 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.05 
 
 		 864 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  33.18 
 
 		 842 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.7 
 
 		 876 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  32.11 
 
 		 866 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.22 
 
 		 835 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.99 
 
 		 866 aa  412  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  31.42 
 
 		 819 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.71 
 
 		 853 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  31.91 
 
 		 866 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  31.91 
 
 		 866 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.04 
 
 		 851 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  31.99 
 
 		 866 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.48 
 
 		 837 aa  409  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>