More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1453 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  99.74 
 
 
390 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  99.53 
 
 
430 aa  861    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  100 
 
 
430 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  99.53 
 
 
430 aa  861    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  99.53 
 
 
430 aa  861    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  99.53 
 
 
430 aa  861    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  99.77 
 
 
430 aa  863    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  81.59 
 
 
390 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  81.07 
 
 
390 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  84.37 
 
 
390 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  84.74 
 
 
390 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  84.47 
 
 
390 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  83.92 
 
 
390 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  83.92 
 
 
390 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  59.89 
 
 
394 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  59.16 
 
 
387 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  57.14 
 
 
386 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  58.42 
 
 
386 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  57.14 
 
 
386 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  56.89 
 
 
386 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  56.89 
 
 
386 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  57.14 
 
 
386 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  57.72 
 
 
385 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  57.81 
 
 
411 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  57.81 
 
 
384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  57.81 
 
 
430 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  57.81 
 
 
430 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  57.81 
 
 
384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  57.81 
 
 
384 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  57.68 
 
 
523 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  53.61 
 
 
389 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  57.81 
 
 
384 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  57.72 
 
 
385 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  57.77 
 
 
388 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  55.61 
 
 
386 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  57.72 
 
 
385 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  56.28 
 
 
386 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  55.73 
 
 
393 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  55.2 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  56.91 
 
 
385 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  56.91 
 
 
385 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  56.64 
 
 
385 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  56.57 
 
 
376 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  56.57 
 
 
376 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  56.3 
 
 
376 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  51.7 
 
 
404 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  50.25 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  51.49 
 
 
399 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  51.49 
 
 
399 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  51.49 
 
 
399 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  51.49 
 
 
399 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  51.67 
 
 
391 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  51.67 
 
 
399 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  51.33 
 
 
386 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  51.62 
 
 
376 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  50.54 
 
 
386 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  50.78 
 
 
386 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  48.7 
 
 
386 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  51.23 
 
 
386 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  51.23 
 
 
386 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.36 
 
 
389 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.45 
 
 
397 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  45.23 
 
 
421 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  45.23 
 
 
421 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.33 
 
 
385 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.33 
 
 
385 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  46.7 
 
 
397 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.91 
 
 
436 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.32 
 
 
436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  47.21 
 
 
386 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  47.21 
 
 
386 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  47.21 
 
 
386 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  47.21 
 
 
386 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  47.21 
 
 
386 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  45.59 
 
 
397 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.7 
 
 
445 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  45.45 
 
 
397 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  46.95 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.59 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.07 
 
 
383 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.33 
 
 
383 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.68 
 
 
383 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.68 
 
 
383 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  45.55 
 
 
395 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  45.55 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  44.73 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  46.72 
 
 
398 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.78 
 
 
391 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  44.24 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  46.45 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.6 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  44.72 
 
 
379 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.01 
 
 
389 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  48.35 
 
 
402 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0452  porin  49.15 
 
 
292 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  42.29 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  44.96 
 
 
381 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  41.5 
 
 
394 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  42.12 
 
 
395 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  44.13 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>