More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1451 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  76.28 
 
 		 857 aa  1141    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  68 
 
 		 821 aa  1103    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  71.16 
 
 		 732 aa  986    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  99.64 
 
 		 844 aa  1694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  59.71 
 
 		 686 aa  823    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  99.76 
 
 		 839 aa  1685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  99.88 
 
 		 844 aa  1697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  73.05 
 
 		 698 aa  1018    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  68.94 
 
 		 850 aa  1033    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  70.35 
 
 		 787 aa  994    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  64.31 
 
 		 810 aa  917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  100 
 
 		 928 aa  1873    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  69.01 
 
 		 742 aa  995    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  75.23 
 
 		 862 aa  1155    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  91.81 
 
 		 787 aa  1349    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  65.29 
 
 		 841 aa  902    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  59.8 
 
 		 678 aa  789    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  75.45 
 
 		 888 aa  1125    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  60.8 
 
 		 675 aa  812    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  64.51 
 
 		 801 aa  912    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  72.95 
 
 		 838 aa  1103    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  70.72 
 
 		 743 aa  1004    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  65.89 
 
 		 846 aa  905    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  64.02 
 
 		 846 aa  923    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  71.47 
 
 		 826 aa  1029    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  75.66 
 
 		 858 aa  1156    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  70.72 
 
 		 743 aa  1005    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  72.58 
 
 		 857 aa  1145    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.11 
 
 		 834 aa  1074    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  99.88 
 
 		 839 aa  1686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  75.57 
 
 		 870 aa  1142    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  70.31 
 
 		 728 aa  981    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  72.58 
 
 		 857 aa  1145    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  70.72 
 
 		 743 aa  1005    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  99.88 
 
 		 844 aa  1697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.47 
 
 		 846 aa  918    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  99.88 
 
 		 844 aa  1697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  48.36 
 
 		 783 aa  592  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.83 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  38.54 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.09 
 
 		 850 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  38.22 
 
 		 774 aa  429  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.26 
 
 		 730 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.34 
 
 		 815 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.35 
 
 		 760 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.34 
 
 		 752 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.24 
 
 		 755 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  35.52 
 
 		 854 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  35.5 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.44 
 
 		 762 aa  411  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.82 
 
 		 786 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.23 
 
 		 794 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.07 
 
 		 767 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  36.78 
 
 		 772 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.44 
 
 		 740 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.08 
 
 		 786 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.46 
 
 		 765 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.28 
 
 		 759 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.19 
 
 		 785 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 		 907 aa  360  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.28 
 
 		 776 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.9 
 
 		 773 aa  357  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 768 aa  351  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  32.91 
 
 		 792 aa  311  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 817 aa  308  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 		 791 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 646 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  33.42 
 
 		 790 aa  300  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.52 
 
 		 648 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 		 748 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.54 
 
 		 661 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 795 aa  294  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  31.5 
 
 		 831 aa  293  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.09 
 
 		 640 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.02 
 
 		 648 aa  290  8e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 835 aa  287  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.19 
 
 		 824 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 		 824 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.39 
 
 		 679 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 		 683 aa  283  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 793 aa  283  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.13 
 
 		 707 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  34.88 
 
 		 714 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.51 
 
 		 709 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  30.85 
 
 		 830 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.17 
 
 		 791 aa  280  9e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.98 
 
 		 709 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.98 
 
 		 709 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  30.04 
 
 		 827 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  29 
 
 		 794 aa  278  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.9 
 
 		 761 aa  276  9e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.48 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.77 
 
 		 626 aa  275  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  31.55 
 
 		 793 aa  274  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.61 
 
 		 705 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 713 aa  274  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 713 aa  274  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 713 aa  274  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 713 aa  273  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>