28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1313 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  100 
 
 
722 aa  1372    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  100 
 
 
180 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  100 
 
 
168 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  91.67 
 
 
180 aa  357  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  72.57 
 
 
177 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  73.14 
 
 
177 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  70.69 
 
 
177 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  70.69 
 
 
177 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  70.11 
 
 
177 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  70.69 
 
 
177 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  53.25 
 
 
176 aa  184  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  40.45 
 
 
165 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  41.04 
 
 
156 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  40.82 
 
 
163 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  42.07 
 
 
185 aa  91.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  32.73 
 
 
152 aa  74.3  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  43.94 
 
 
165 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  45.07 
 
 
143 aa  54.7  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  36.88 
 
 
163 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  41.82 
 
 
160 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  48.08 
 
 
157 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  35.87 
 
 
148 aa  48.5  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  50 
 
 
147 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.44 
 
 
140 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  53.49 
 
 
140 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  33.72 
 
 
137 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  37.88 
 
 
135 aa  45.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.86 
 
 
145 aa  44.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>