More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1247 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  100 
 
 		 330 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  94.24 
 
 		 330 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  77.04 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  77.04 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  77.04 
 
 		 330 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  74.85 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  75.15 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  75.94 
 
 		 331 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  73.03 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  64.94 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  65.24 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  65.86 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  51.14 
 
 		 334 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  51.9 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  46.93 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  51.23 
 
 		 294 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  39.87 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  39.81 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  38.61 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  37.83 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  43.18 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  38.58 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  35.88 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  39.49 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  39.66 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  33.77 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  35.37 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  34.22 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  34.22 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  34.22 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  34.22 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  34.22 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  34.22 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  35.67 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  39.46 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  34.44 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  35.33 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  35.33 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  35.33 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  35.33 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  35.33 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  35.33 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  35.74 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  37.71 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  34.08 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  34.42 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  33.84 
 
 		 268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  30.96 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  32.95 
 
 		 201 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  30.81 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  32.53 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  32.53 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  31.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  31.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  31.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  31.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  31.93 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.05 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.95 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.32 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.33 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  32.19 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.62 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  29.66 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  29.44 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.63 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  33.74 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  31.71 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  31.31 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  30.49 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.32 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.76 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  30.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  30.92 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  28.4 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  25.98 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.49 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  25.98 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  32.3 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>