More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1222 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  99.55 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  99.55 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  99.55 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  99.55 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  99.11 
 
 
230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  86.61 
 
 
224 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  73.64 
 
 
231 aa  338  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  62.1 
 
 
221 aa  269  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  62.56 
 
 
221 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  61.93 
 
 
221 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  59.07 
 
 
233 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  51.83 
 
 
227 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  52.97 
 
 
222 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  54.09 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 
221 aa  231  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  224  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
235 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
235 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
235 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  53.05 
 
 
223 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  52.05 
 
 
218 aa  218  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  51.64 
 
 
218 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
222 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  90.27 
 
 
124 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  90.27 
 
 
124 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  51.83 
 
 
218 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  51.87 
 
 
221 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  46.61 
 
 
227 aa  197  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  48.37 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
218 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
227 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
226 aa  187  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  44.39 
 
 
234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
220 aa  177  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  45.58 
 
 
223 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  44.75 
 
 
184 aa  167  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
219 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  42 
 
 
219 aa  165  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
253 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
222 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  61.61 
 
 
114 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  39.25 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  40.68 
 
 
128 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
106 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
471 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  43.28 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.17 
 
 
480 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
136 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  40.3 
 
 
102 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  40 
 
 
133 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
136 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  42.71 
 
 
116 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 
112 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  43.01 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.61 
 
 
142 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
470 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
122 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 
138 aa  62  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0437  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
147 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  40.23 
 
 
139 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 
550 aa  61.6  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
139 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
111 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
150 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  43.82 
 
 
126 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  41.77 
 
 
820 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.84 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
122 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 
480 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
113 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  40.22 
 
 
139 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
122 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0103  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.86 
 
 
565 aa  59.7  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
114 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
114 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.8 
 
 
361 aa  58.9  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  39.58 
 
 
459 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
478 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 
116 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 
110 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
136 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  41.03 
 
 
110 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  38.54 
 
 
137 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 
454 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  30.36 
 
 
127 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  30.36 
 
 
127 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
368 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>