More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1184 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 413 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  100 
 
 		 399 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  57.97 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  50.98 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  47.67 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  44.84 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  43.46 
 
 		 420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  41.56 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  41.33 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 421 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  38.83 
 
 		 417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  41.13 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  39.07 
 
 		 417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  40.86 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  43.1 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.81 
 
 		 380 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 412 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 414 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  34.89 
 
 		 441 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  31.04 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  31.06 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 631 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 441 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 448 aa  126  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.04 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  29.06 
 
 		 434 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  25.71 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.62 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.25 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.38 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.98 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 451 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.2 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  27.42 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 451 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 470 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.37 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.82 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.35 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>