144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1034 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  99.74 
 
 		 378 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 378 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  96.03 
 
 		 378 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  99.74 
 
 		 378 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  99.21 
 
 		 378 aa  748    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  99.74 
 
 		 378 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  99.74 
 
 		 378 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  82.54 
 
 		 378 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  85.71 
 
 		 378 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  85.19 
 
 		 378 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  73.02 
 
 		 378 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  73.02 
 
 		 378 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  73.81 
 
 		 384 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  71.73 
 
 		 398 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  69.58 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  58.99 
 
 		 378 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  58.99 
 
 		 378 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  55.82 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  55.03 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  38.44 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  36.46 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  34.97 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 381 aa  199  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  30.88 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  28.98 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  30.08 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  26.84 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  27.18 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  27.78 
 
 		 374 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.12 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  23.83 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 406 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  21.93 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  27.67 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  25.58 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  22.31 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.48 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  23.1 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  24.4 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  24.31 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  23.91 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  26.07 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  21.88 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  26.53 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  23.45 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  19.45 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  23.15 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.44 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  28.97 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.39 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  24.04 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  22.19 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  28.28 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  22.19 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.17 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  23.43 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  25.9 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.86 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  22.05 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.05 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  21.94 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.3 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  22.06 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  20.56 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.55 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  25 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.69 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  22.68 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.2 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  21.63 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  22.25 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  22.25 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  29.91 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  20.97 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.62 
 
 		 843 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.54 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.09 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  21.17 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  21.52 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  34.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  34.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  34.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.54 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  34.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  32.5 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  25.15 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  29.3 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  22.73 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  22.43 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 643 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  34.17 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>