187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1004 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  316  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 161 aa  315  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  86.99 
 
 		 173 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.5 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2286  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.86 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  33.68 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.17 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  28.99 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1929  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0438098  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 194 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06420  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>