More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0621 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  98.85 
 
 
260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  96.54 
 
 
260 aa  500  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 
264 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  57.48 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
263 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  61.22 
 
 
262 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  58.61 
 
 
264 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  62.83 
 
 
261 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  60.41 
 
 
262 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  58.58 
 
 
255 aa  288  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  57.87 
 
 
255 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  57.87 
 
 
255 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  57.87 
 
 
255 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  59.18 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  56.98 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  55.25 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  56.59 
 
 
265 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  56.59 
 
 
265 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  56.59 
 
 
265 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  56.2 
 
 
265 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 
271 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  54.65 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  58.67 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  55.74 
 
 
262 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  54.25 
 
 
270 aa  271  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.59 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.59 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
255 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  52.19 
 
 
255 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  54.75 
 
 
265 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  56.38 
 
 
263 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  57.08 
 
 
263 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.59 
 
 
263 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
255 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  58.78 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  52.19 
 
 
255 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  51.79 
 
 
255 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  56.72 
 
 
259 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  54.14 
 
 
265 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 
264 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  52.08 
 
 
262 aa  263  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  54.37 
 
 
258 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  54.66 
 
 
269 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  53.82 
 
 
262 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  51.42 
 
 
270 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  56.38 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  48.56 
 
 
268 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  51.44 
 
 
278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.21 
 
 
261 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.5 
 
 
262 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.63 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.95 
 
 
259 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
267 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  50.45 
 
 
267 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
259 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  53.96 
 
 
255 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.65 
 
 
264 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  43.95 
 
 
257 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.77 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.68 
 
 
282 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50 
 
 
283 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.72 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.4 
 
 
261 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  54.17 
 
 
257 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.26 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.74 
 
 
273 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  43.75 
 
 
271 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.11 
 
 
252 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
278 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  50.73 
 
 
286 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.57 
 
 
259 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.22 
 
 
251 aa  215  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.02 
 
 
259 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44.14 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.53 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.29 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  49.3 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.43 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.28 
 
 
293 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.28 
 
 
293 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45 
 
 
259 aa  211  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
276 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  45.42 
 
 
276 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.12 
 
 
253 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.24 
 
 
279 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
264 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  52.88 
 
 
263 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
273 aa  207  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.28 
 
 
253 aa  208  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.96 
 
 
258 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>