38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0537 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  99.35 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  98.69 
 
 
153 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  98.69 
 
 
153 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  98.69 
 
 
153 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  296  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  86.96 
 
 
158 aa  234  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  40.85 
 
 
135 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  32.08 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  27.42 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1803  GPW/gp25 family protein  33.73 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200889  normal  0.04666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  29.25 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.56 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  29.77 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  29.25 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  34.45 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3242  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.46 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.963032  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0803  hypothetical protein  30.56 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2486  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2996  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000361567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3134  hypothetical protein  32.95 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5259  hypothetical protein  30.3 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2584  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.73 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  34.15 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  27.36 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0617  hypothetical protein  32.53 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  33.93 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.93 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  33.93 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.41 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  30.43 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.33 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>