More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0381 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0909  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  100 
 
 
150 aa  306  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  95.97 
 
 
150 aa  294  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  74.13 
 
 
150 aa  226  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  64.54 
 
 
165 aa  186  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  65.69 
 
 
145 aa  186  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  59.85 
 
 
145 aa  182  1e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  62.77 
 
 
143 aa  181  4e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  63.5 
 
 
146 aa  180  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  61.59 
 
 
149 aa  178  3e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  62.77 
 
 
148 aa  177  3e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  59.85 
 
 
145 aa  175  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  59.85 
 
 
148 aa  174  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  63.85 
 
 
146 aa  174  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  57.53 
 
 
150 aa  174  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  62.04 
 
 
144 aa  173  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  60.14 
 
 
139 aa  173  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  57.25 
 
 
146 aa  167  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  57.66 
 
 
139 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  56.12 
 
 
153 aa  165  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  54.23 
 
 
148 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  52.45 
 
 
146 aa  164  3e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  55.4 
 
 
149 aa  164  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  56.34 
 
 
147 aa  162  2e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  56.52 
 
 
154 aa  162  2e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  55.8 
 
 
154 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
146 aa  158  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  55.88 
 
 
148 aa  158  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  54.74 
 
 
148 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  54.23 
 
 
148 aa  155  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
146 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  52.74 
 
 
148 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  56.43 
 
 
181 aa  154  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  51.45 
 
 
148 aa  153  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
147 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  54.29 
 
 
145 aa  152  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
147 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
147 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  50.72 
 
 
146 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  52.14 
 
 
148 aa  151  3e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  54.81 
 
 
147 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  54.81 
 
 
147 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  50.7 
 
 
145 aa  147  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  47.22 
 
 
151 aa  144  4e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  47.52 
 
 
144 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
144 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  51.43 
 
 
150 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  50.71 
 
 
151 aa  140  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  47.18 
 
 
152 aa  139  1e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  46.62 
 
 
160 aa  139  1e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  48.91 
 
 
144 aa  132  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  48.2 
 
 
167 aa  127  4e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  49.28 
 
 
152 aa  126  8e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  46.48 
 
 
149 aa  126  9e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
150 aa  123  8e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
162 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
153 aa  120  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  45.19 
 
 
143 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  43.66 
 
 
148 aa  118  2e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
151 aa  118  2e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  45.39 
 
 
160 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
156 aa  117  4e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
162 aa  117  4e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  42.34 
 
 
146 aa  117  4e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
152 aa  117  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  40.28 
 
 
148 aa  116  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
153 aa  115  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  41.61 
 
 
155 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 
147 aa  114  4e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  42.34 
 
 
146 aa  113  8e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
146 aa  112  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  39.01 
 
 
171 aa  112  2e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
149 aa  112  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
145 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  41.01 
 
 
151 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
148 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  40.43 
 
 
153 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.55 
 
 
153 aa  111  4e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
146 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  37.86 
 
 
146 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  43.66 
 
 
164 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  43.26 
 
 
173 aa  110  7e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
149 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  42.07 
 
 
149 aa  110  1e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  43.66 
 
 
155 aa  109  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5796  response regulator receiver protein  40.44 
 
 
138 aa  108  2e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.01 
 
 
153 aa  108  2e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  44.03 
 
 
152 aa  108  2e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  43.18 
 
 
156 aa  109  2e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  38.51 
 
 
151 aa  108  2e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
153 aa  107  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
151 aa  107  4e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
153 aa  107  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  42.07 
 
 
151 aa  107  4e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 
146 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>