More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0324 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  64.42 
 
 
493 aa  666    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  63.69 
 
 
512 aa  670    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  73.58 
 
 
517 aa  781    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  66.12 
 
 
512 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  62.82 
 
 
512 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  62.82 
 
 
512 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  81.54 
 
 
520 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  62.82 
 
 
512 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  75.44 
 
 
518 aa  766    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  80.38 
 
 
520 aa  852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  77.65 
 
 
520 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  64.09 
 
 
512 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  85.38 
 
 
520 aa  920    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  63.89 
 
 
512 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  63.98 
 
 
514 aa  675    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  63.69 
 
 
512 aa  670    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  95.19 
 
 
520 aa  1019    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  64.48 
 
 
514 aa  677    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  61.72 
 
 
520 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  73.19 
 
 
517 aa  769    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  62.62 
 
 
512 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  82.03 
 
 
520 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  63.49 
 
 
512 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1408  extracellular solute-binding protein  77.85 
 
 
518 aa  761    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00741999  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  63.69 
 
 
512 aa  671    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  63.89 
 
 
512 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  80.38 
 
 
520 aa  851    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  65.69 
 
 
512 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  62.82 
 
 
512 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  81.54 
 
 
520 aa  866    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  64.09 
 
 
512 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  79.04 
 
 
520 aa  860    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  80.38 
 
 
520 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  81.25 
 
 
520 aa  860    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  73.19 
 
 
521 aa  770    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  100 
 
 
520 aa  1059    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  63.22 
 
 
519 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  62.66 
 
 
509 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  61.72 
 
 
517 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  61.91 
 
 
516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  59.8 
 
 
516 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  61.08 
 
 
517 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 
510 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  41.86 
 
 
513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  43.62 
 
 
518 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  41.47 
 
 
513 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  44.26 
 
 
513 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  34.42 
 
 
534 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.99 
 
 
520 aa  259  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  33.81 
 
 
535 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.82 
 
 
521 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.82 
 
 
521 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.82 
 
 
521 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.82 
 
 
521 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
521 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 
495 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.06 
 
 
509 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  33.55 
 
 
524 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  31.01 
 
 
523 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  31.01 
 
 
544 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 
544 aa  211  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 
528 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 
540 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.4 
 
 
540 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 
528 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.25 
 
 
502 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.73 
 
 
517 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.89 
 
 
528 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
531 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.37 
 
 
531 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.25 
 
 
528 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.89 
 
 
528 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
531 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.69 
 
 
528 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
528 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
528 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.69 
 
 
528 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.69 
 
 
528 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 
538 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
534 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
534 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  32.2 
 
 
540 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
531 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.16 
 
 
490 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
505 aa  203  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.02 
 
 
531 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  28.75 
 
 
532 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
531 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
530 aa  200  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 
521 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.78 
 
 
532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>