158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0282 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  100 
 
 
238 aa  466  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  99.16 
 
 
238 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  99.16 
 
 
238 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  99.16 
 
 
238 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  99.16 
 
 
238 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  98.74 
 
 
238 aa  459  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
188 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
209 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  36.9 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
180 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
188 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
205 aa  80.1  3e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
205 aa  80.1  3e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
205 aa  78.2  1e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
207 aa  75.5  6e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
177 aa  75.5  7e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 
188 aa  75.1  9e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
184 aa  73.6  3e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
186 aa  72.8  5e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
187 aa  72.4  6e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  69.7  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
206 aa  68.9  6e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 
199 aa  68.6  8e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  33.11 
 
 
198 aa  67.8  1e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
179 aa  68.6  1e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
184 aa  67.4  2e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 
187 aa  67  3e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  27.44 
 
 
207 aa  65.9  5e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  65.5  6e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
187 aa  64.3  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
205 aa  64.3  2e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
202 aa  63.5  3e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  63.2  3e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
192 aa  62.4  6e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
187 aa  62  9e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
188 aa  61.6  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
214 aa  61.2  1e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
224 aa  61.2  1e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
180 aa  60.8  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
211 aa  60.8  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
202 aa  60.5  2e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
197 aa  60.1  3e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
186 aa  57.8  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
211 aa  57.8  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
211 aa  57.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
211 aa  57.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
209 aa  57  3e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
215 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
209 aa  53.1  4e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
217 aa  52.8  5e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  28.32 
 
 
182 aa  52.8  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
217 aa  52.8  5e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
231 aa  52  8e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
194 aa  51.6  1e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
182 aa  50.8  2e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  30.25 
 
 
215 aa  50.4  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  51.2  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
185 aa  50.1  3e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
211 aa  50.1  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  29.63 
 
 
189 aa  49.7  4e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
197 aa  49.3  5e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
209 aa  49.3  6e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
210 aa  48.9  6e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
196 aa  48.9  6e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 
204 aa  48.5  8e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  29.14 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  31.9 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
192 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
228 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
227 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
424 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  28.46 
 
 
195 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  36.36 
 
 
208 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  18.71 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
212 aa  45.4  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  37.21 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  34.55 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
453 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0569  nucleoid occlusion protein  32.03 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>