More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0129 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  99.61 
 
 
259 aa  533  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  91.57 
 
 
261 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  80.77 
 
 
260 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  80.77 
 
 
260 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  80.77 
 
 
260 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  80.77 
 
 
260 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  80.77 
 
 
260 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.23 
 
 
242 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.23 
 
 
242 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.23 
 
 
260 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.49 
 
 
257 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.08 
 
 
257 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  70 
 
 
266 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.31 
 
 
257 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.9 
 
 
257 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.9 
 
 
259 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.49 
 
 
259 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.49 
 
 
259 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.08 
 
 
259 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.15 
 
 
257 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.46 
 
 
259 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.05 
 
 
259 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.96 
 
 
403 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.4 
 
 
267 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.61 
 
 
248 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.42 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.65 
 
 
248 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.65 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.65 
 
 
248 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.96 
 
 
248 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
249 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
630 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
251 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  56.52 
 
 
251 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.52 
 
 
251 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.26 
 
 
224 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 
251 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 
251 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 
251 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 
251 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.8 
 
 
218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  56.36 
 
 
247 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.85 
 
 
261 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.85 
 
 
261 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.16 
 
 
245 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 
239 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.89 
 
 
262 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  53.78 
 
 
257 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.91 
 
 
263 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.91 
 
 
263 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  52.21 
 
 
266 aa  257  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.41 
 
 
246 aa  255  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.57 
 
 
242 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.57 
 
 
247 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  56.95 
 
 
269 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.57 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.42 
 
 
274 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.22 
 
 
264 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.7 
 
 
272 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.91 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.43 
 
 
247 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.12 
 
 
262 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.83 
 
 
223 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.69 
 
 
232 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  43.36 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.92 
 
 
242 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  43.11 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.92 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.14 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.25 
 
 
250 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
244 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
253 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.15 
 
 
250 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 
250 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 
250 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 
250 aa  202  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 
250 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 
250 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1673  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.52 
 
 
250 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349784  normal  0.0983377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.52 
 
 
250 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.52 
 
 
250 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.251439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.52 
 
 
250 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1785  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.52 
 
 
250 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.377507  normal  0.141635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.15 
 
 
250 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.35 
 
 
250 aa  201  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
244 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.07 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  41.07 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  41.33 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.64 
 
 
250 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.07 
 
 
250 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  41.18 
 
 
244 aa  198  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.62 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.18 
 
 
250 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.18 
 
 
250 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>